Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08555 Date Thu Jan 5 11:01:32 GMT 2012 Unique Job ID f244b65a902eb5fc

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	S	Q	I	W	V	V	S	T	L	L	I	S	I	V	L	I	V	L	T	I	V	K	F	K	F	H	P	F	L	A	L	L	L	A	S	F	F	V	G	T	M	M	G	M	G	P	L	D	M	V	N	A	I	E	S	G	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	T	L	G	F	L	A	A	V	I	G	L	G	T	I	L	G	K	M	M	E	V	S	G	A	A	E	R	I	G	L	T	L	Q	R	C	R	W	L	S	V	D	V	I	M	V	L	V	G	L	I	C	G	I	T	L	F	V	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	V	V	L	L	I	P	L	A	F	S	I	A	K	K	T	N	T	S	L	L	K	L	A	I	P	L	C	T	A	L	M	A	V	H	C	V	V	P	P	H	P	A	A	L	Y	V	A	N	K	L	G	A	D	I	G	S	V	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	G	L	L	V	G	L	M	A	S	L	I	G	G	P	L	F	L	K	F	L	G	Q	R	L	P	F	K	P	V	P	T	E	F	A	D	L	K	V	R	D	E	K	T	L	P	S	L	G	A	T	L	F	T	I	L	L	P	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	M	L	V	K	T	I	A	E	L	N	M	A	R	E	S	G	L	Y	I	L	V	E	F	I	G	N	P	I	T	A	M	F	I	A	V	F	V	A	Y	Y	V	L	G	I	R	Q	H	M	S	M	G	T	M	L	T	H	T	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?		?		?																														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	F	G	S	I	A	N	I	L	L	I	I	G	A	G	G	A	F	N	A	I	L	K	S	S	S	L	A	D	T	L	A	V	I	L	S	N	M	H	M	H	P	I	L	L	A	W	L	V	A	L	I	L	H	A	A	V	G	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	V	A	M	M	G	A	T	A	I	V	A	P	M	L	P	L	Y	P	D	I	S	P	E	I	I	A	I	A	I	G	S	G	A	I	G	C	T	I	V	T	D	S	L	F	W	L	V	K	Q	Y	C	G	A	T	L	N	E	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Sequence		K	Y	Y	T	T	A	T	F	I	A	S	V	V	A	L	A	G	T	F	L	L	S	F	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand