Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P02921 Date Thu Jan 5 10:57:37 GMT 2012 Unique Job ID f1ebd18e6787ca4f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	I	S	M	T	T	K	L	S	Y	G	F	G	A	F	G	K	D	F	A	I	G	I	V	Y	M	Y	L	M	Y	Y	Y	T	D	V	V	G	L	S	V	G	L	V	G	T	L	F	L	V	A	R	I	W	D	A	I	N	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	M	G	W	I	V	N	A	T	R	S	R	W	G	K	F	K	P	W	I	L	I	G	T	L	A	N	S	V	I	L	F	L	L	F	S	A	H	L	F	E	G	T	T	Q	I	V	F	V	C	V	T	Y	I	L	W	G	M	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	I	M	D	I	P	F	W	S	L	V	P	T	I	T	L	D	K	R	E	R	E	Q	L	V	P	Y	P	R	F	F	A	S	L	A	G	F	V	T	A	G	V	T	L	P	F	V	N	Y	V	G	G	G	D	R	G	F	G	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	F	T	L	V	L	I	A	F	F	I	V	S	T	I	I	T	L	R	N	V	H	E	V	F	S	S	D	N	Q	P	S	A	E	G	S	H	L	T	L	K	A	I	V	A	L	I	Y	K	N	D	Q	L	S	C	L	L	G	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	A	Y	N	V	A	S	N	I	I	T	G	F	A	I	Y	Y	F	S	Y	V	I	G	D	A	D	L	F	P	Y	Y	L	S	Y	A	G	A	A	N	L	V	T	L	V	F	F	P	R	L	V	K	S	L	S	R	R	I	L	W	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	S	I	L	P	V	L	S	C	G	V	L	L	L	M	A	L	M	S	Y	H	N	V	V	L	I	V	I	A	G	I	L	L	N	V	G	T	A	L	F	W	V	L	Q	V	I	M	V	A	D	I	V	D	Y	G	E	Y	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		H	V	R	C	E	S	I	A	Y	S	V	Q	T	M	V	V	K	G	G	S	A	F	A	A	F	F	I	A	V	V	L	G	M	I	G	Y	V	P	N	V	E	Q	S	T	Q	A	L	L	G	M	Q	F	I	M	I	A	L	P	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Sequence		F	F	M	V	T	L	I	L	Y	F	R	F	Y	R	L	N	G	D	T	L	R	R	I	Q	I	H	L	L	D	K	Y	R	K	V	P	P	E	P	V	H	A	D	I	P	V	G	A	V	S	D	V	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand