Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77381 Date Thu Jan 5 12:28:25 GMT 2012 Unique Job ID f13a43100504e0ca

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	N	C	W	K	I	L	D	I	E	E	T	T	D	V	D	I	I	R	R	A	Y	L	A	L	L	P	S	F	H	P	E	T	D	P	Q	G	F	K	Q	L	R	Q	A	Y	E	E	A	L	R	I	A	Q	S	P	A	K	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?										?	?	?																			?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	Q	P	E	E	Y	E	V	A	E	H	E	I	L	L	A	F	R	A	L	L	A	S	D	S	E	R	F	L	P	S	A	W	Q	R	F	I	Q	Q	L	N	Y	C	S	M	E	E	I	D	E	L	R	W	S	L	C	T	I	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?					?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	T	A	H	L	S	F	E	C	V	V	L	L	A	E	R	L	R	W	L	Q	E	E	N	T	G	E	I	D	E	E	E	L	E	S	F	L	Y	A	I	A	K	G	N	V	F	N	F	Q	T	I	L	H	L	P	V	A	V	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	T	I	D	F	Y	Q	M	F	A	R	I	W	S	S	H	P	Q	W	L	T	L	Y	L	A	Q	H	R	A	V	I	I	P	D	D	A	K	L	H	R	N	L	L	R	W	Y	S	A	G	R	L	D	I	P	E	L	L	D	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?																				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	S	W	R	E	T	E	P	D	N	E	D	A	P	Y	Y	E	Y	A	Q	R	V	Y	C	G	E	G	E	S	L	L	A	E	L	C	D	Y	W	R	E	Y	P	S	T	Q	A	D	A	L	M	L	Q	W	C	R	Q	H	R	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	Y	P	L	L	V	M	M	I	E	A	R	D	L	V	N	D	Q	G	K	P	L	L	Y	V	P	G	D	S	A	R	T	R	F	H	L	Y	E	I	L	S	D	E	K	L	S	A	L	G	R	S	L	V	E	M	V	L	H	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?		?																										?	?	?	?	?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	K	P	R	I	S	L	T	R	D	T	E	H	T	L	W	P	L	Y	L	V	A	K	Q	L	V	Q	A	C	Q	P	T	E	E	S	L	M	P	I	V	S	R	L	D	A	E	N	R	C	P	L	E	A	L	I	I	R	R	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Sequence		I	Q	A	A	N	F	T	E	K	Q	T	V	E	P	E	P	Q	P	Q	P	M	P	V	D	D	G	G	P	G	C	L	G	I	I	K	I	I	F	Y	I	F	I	F	A	G	L	I	G	K	I	L	H	L	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand