Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q00042 Date Thu Jan 5 12:33:20 GMT 2012 Unique Job ID f0933668b5048262

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	L	N	I	T	S	K	S	N	P	F	G	D	T	T	A	E	N	D	K	K	M	L	S	N	A	F	I	E	T	A	D	F	R	T	L	I	E	T	D	D	R	T	I	V	V	G	R	R	G	T	G	K	S	A	L	F	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	N	E	H	W	K	K	D	K	K	I	L	I	L	S	F	S	P	D	D	S	Q	I	I	G	F	R	S	M	L	K	P	F	T	G	S	F	N	L	A	R	A	A	T	R	L	L	W	R	Y	A	M	L	M	E	I	A	S	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?	?														?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	S	H	Y	K	L	S	S	Q	I	S	S	E	T	L	L	N	E	H	L	K	K	W	N	S	A	Q	G	D	I	L	R	K	C	R	L	V	A	K	E	Y	L	D	E	N	N	P	E	E	S	I	G	D	L	Q	F	N	L	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?	?	?	?	?	?														?	?			?					?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	E	I	E	N	N	I	V	S	L	L	E	R	S	D	R	K	V	V	I	L	M	D	K	L	D	E	A	Y	E	P	D	N	I	G	I	G	I	I	A	G	L	A	Y	A	S	I	E	L	N	Q	K	A	K	C	I	R	P	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	L	R	D	N	I	F	R	S	L	S	K	E	D	P	D	Y	S	R	N	I	E	G	Q	V	I	R	L	H	W	D	W	A	Q	L	L	M	L	S	A	K	R	M	K	V	A	F	K	L	D	I	E	K	D	Q	R	V	W	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	T	A	D	D	L	K	G	R	N	G	F	K	R	C	L	Q	F	T	L	Y	R	P	R	D	L	L	S	L	L	N	E	A	F	F	S	A	F	R	E	N	R	E	T	I	I	N	T	D	L	E	Y	A	A	K	S	I	S	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?																															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	L	E	D	L	W	K	E	Y	Q	K	I	F	P	S	I	Q	V	I	T	S	A	F	R	S	I	E	P	E	L	T	V	Y	T	C	L	K	K	I	E	A	S	F	E	L	I	E	E	N	G	D	P	K	I	T	S	E	I	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?																					?	?	?	?	?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	K	A	S	G	I	L	Q	S	L	Y	S	V	G	F	V	G	I	R	D	K	N	T	S	S	Y	S	F	C	H	D	G	R	T	P	D	K	G	F	E	S	N	E	K	L	L	I	H	P	C	Y	W	L	G	L	N	L	N	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?		?	?		?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	L	A	P	E	E	A	E	E	I	N	D	E	Y	D	I	N	I	I	S	D	N	S	A	I	R	N	K	T	I	G	Q	I	T	T	H	L	D	Q	I	P	I	G	N	E	G	A	T	E	F	E	Q	W	C	L	D	A	L	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?						?	?	?	?		?								?	?				?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	F	A	S	H	L	T	D	I	K	S	H	P	N	G	N	A	V	Q	R	R	D	I	I	G	T	N	G	G	K	S	D	F	W	K	R	V	L	E	D	Y	K	T	R	Q	V	V	F	D	A	K	N	F	E	E	L	G	P	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Y	R	Q	L	Q	S	Y	L	T	G	P	Y	G	K	L	G	F	I	I	N	R	D	E	S	E	V	L	K	S	G	K	D	L	D	W	T	K	E	M	Y	Q	S	H	N	S	L	I	I	K	L	P	A	K	Y	I	S	K	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	L	R	N	P	E	K	H	D	A	I	D	R	Q	M	G	K	L	L	T	L	Y	E	T	S	Y	M	A	I	K	S	T	Q	K	K	R	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand