Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36655 Date Thu Jan 5 11:53:30 GMT 2012 Unique Job ID f02c58eb44ccad7b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	R	I	F	T	L	I	L	L	L	C	S	T	S	V	F	A	G	L	F	D	A	P	G	R	S	Q	F	V	P	A	D	Q	A	F	A	F	D	F	Q	Q	N	Q	H	D	L	N	L	T	W	Q	I	K	D	G	Y	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																?	?	?	?	?			?	?	?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	R	K	Q	I	R	I	T	P	E	H	A	K	I	A	D	V	Q	L	P	Q	G	V	W	H	E	D	E	F	Y	G	K	S	E	I	Y	R	D	R	L	T	L	P	V	T	I	N	Q	A	S	A	G	A	T	L	T	V	T	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?			?																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	C	A	D	A	G	F	C	Y	P	P	E	T	K	T	V	P	L	S	E	V	V	A	N	N	A	A	P	Q	P	V	S	V	P	Q	Q	E	Q	P	T	A	Q	L	P	F	S	A	L	W	A	L	L	I	G	I	G	I	A	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	C	V	L	P	M	Y	P	L	I	S	G	I	V	L	G	G	K	Q	R	L	S	T	A	R	A	L	L	L	T	F	I	Y	V	Q	G	M	A	L	T	Y	T	A	L	G	L	V	V	A	A	A	G	L	Q	F	Q	A	A	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	P	Y	V	L	I	G	L	A	I	V	F	T	L	L	A	M	S	M	F	G	L	F	T	L	Q	L	P	S	S	L	Q	T	R	L	T	L	M	S	N	R	Q	Q	G	G	S	P	G	G	V	F	V	M	G	A	I	A	G	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?		?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	S	P	C	T	T	A	P	L	S	A	I	L	L	Y	I	A	Q	S	G	N	M	W	L	G	G	G	T	L	Y	L	Y	A	L	G	M	G	L	P	L	M	L	I	T	V	F	G	N	R	L	L	P	K	S	G	P	W	M	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	K	T	A	F	G	F	V	I	L	A	L	P	V	F	L	L	E	R	V	I	G	D	V	W	G	L	R	L	W	S	A	L	G	V	A	F	F	G	W	A	F	I	T	S	L	Q	A	K	R	G	W	M	R	I	V	Q	I	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	A	A	A	L	V	S	V	R	P	L	Q	D	W	A	F	G	A	T	H	T	A	Q	T	Q	T	H	L	N	F	T	Q	I	K	T	V	D	E	L	N	Q	A	L	V	E	A	K	G	K	P	V	M	L	D	L	Y	A	D	W	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	A	C	K	E	F	E	K	Y	T	F	S	D	P	Q	V	Q	K	A	L	A	D	T	V	L	L	Q	A	N	V	T	A	N	D	A	Q	D	V	A	L	L	K	H	L	N	V	L	G	L	P	T	I	L	F	F	D	G	Q	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Sequence		E	H	P	Q	A	R	V	T	G	F	M	D	A	E	T	F	S	A	H	L	R	D	R	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand