Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24554 Date Thu Jan 5 11:41:40 GMT 2012 Unique Job ID efb486562a13f3bd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	A	P	K	R	A	F	V	C	N	E	C	G	A	D	Y	P	R	W	Q	G	Q	C	S	A	C	H	A	W	N	T	I	T	E	V	R	L	A	A	S	P	M	V	A	R	N	E	R	L	S	G	Y	A	G	S	A	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																								?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	K	V	Q	K	L	S	D	I	S	L	E	E	L	P	R	F	S	T	G	F	K	E	F	D	R	V	L	G	G	G	V	V	P	G	S	A	I	L	I	G	G	N	P	G	A	G	K	S	T	L	L	L	Q	T	L	C	K	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	Q	M	K	T	L	Y	V	T	G	E	E	S	L	Q	Q	V	A	M	R	A	H	R	L	G	L	P	T	D	N	L	N	M	L	S	E	T	S	I	E	Q	I	C	L	I	A	E	E	E	Q	P	K	L	M	V	I	D	S	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	M	H	M	A	D	V	Q	S	S	P	G	S	V	A	Q	V	R	E	T	A	A	Y	L	T	R	F	A	K	T	R	G	V	A	I	V	M	V	G	H	V	T	K	D	G	S	L	A	G	P	K	V	L	E	H	C	I	D	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	L	L	D	G	D	A	D	S	R	F	R	T	L	R	S	H	K	N	R	F	G	A	V	N	E	L	G	V	F	A	M	T	E	Q	G	L	R	E	V	S	N	P	S	A	I	F	L	S	R	G	D	E	V	T	S	G	S	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?															?	?																									?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	V	V	W	E	G	T	R	P	L	L	V	E	I	Q	A	L	V	D	H	S	M	M	A	N	P	R	R	V	A	V	G	L	E	Q	N	R	L	A	I	L	L	A	V	L	H	R	H	G	G	L	Q	M	A	D	Q	D	V	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	V	V	G	G	V	K	V	T	E	T	S	A	D	L	A	L	L	L	A	M	V	S	S	L	R	D	R	P	L	P	Q	D	L	V	V	F	G	E	V	G	L	A	G	E	I	R	P	V	P	S	G	Q	E	R	I	S	E	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																																									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Sequence		K	H	G	F	R	R	A	I	V	P	A	A	N	V	P	K	K	A	P	E	G	M	Q	I	F	G	V	K	K	L	S	D	A	L	S	V	F	D	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?																					?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand