Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23173 Date Thu Jan 5 11:39:16 GMT 2012 Unique Job ID eea07ff7af1f1a9e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	D	Q	A	E	K	K	H	S	A	F	W	G	V	M	V	I	A	G	T	V	I	G	G	G	M	F	A	L	P	V	D	L	A	G	A	W	F	F	W	G	A	F	I	L	I	I	A	W	F	S	M	L	H	S	G	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	E	A	N	L	N	Y	P	V	G	S	S	F	N	T	I	T	K	D	L	I	G	N	T	W	N	I	I	S	G	I	T	V	A	F	V	L	Y	I	L	T	Y	A	Y	I	S	A	N	G	A	I	I	S	E	T	I	S	M	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	Y	H	A	N	P	R	I	V	G	I	C	T	A	I	F	V	A	S	V	L	W	L	S	S	L	A	A	S	R	I	T	S	L	F	L	G	L	K	I	I	S	F	V	I	V	F	G	S	F	F	F	Q	V	D	Y	S	I	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?																															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	A	T	S	S	T	A	G	T	S	Y	F	P	Y	I	F	M	A	L	P	V	C	L	A	S	F	G	F	H	G	N	I	P	S	L	I	I	C	Y	G	K	R	K	D	K	L	I	K	S	V	V	F	G	S	L	L	A	L	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	L	F	W	L	Y	C	T	M	G	N	I	P	R	E	S	F	K	A	I	I	S	S	G	G	N	V	D	S	L	V	K	S	F	L	G	T	K	Q	H	G	I	I	E	F	C	L	L	V	F	S	N	L	A	V	A	S	S	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?			?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	V	T	L	G	L	F	D	Y	L	A	D	L	F	K	I	D	N	S	H	G	G	R	F	K	T	V	L	L	T	F	L	P	P	A	L	L	Y	L	I	F	P	N	G	F	I	Y	G	I	G	G	A	G	L	C	A	T	I	W	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Sequence		V	I	I	P	A	V	L	A	I	K	A	R	K	K	F	P	N	Q	M	F	T	V	W	G	G	N	L	I	P	A	I	V	I	L	F	G	I	T	V	I	L	C	W	F	G	N	V	F	N	V	L	P	K	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand