Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31666 Date Thu Jan 5 11:48:29 GMT 2012 Unique Job ID eda3e1311e20fe7b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	K	Q	A	V	I	L	L	L	M	L	F	T	A	S	V	S	A	A	L	P	A	R	Y	M	Q	T	I	E	N	A	A	V	W	A	Q	I	G	D	K	M	V	T	V	G	N	I	R	A	G	Q	I	I	A	V	E	P	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?		?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	S	Y	Y	A	F	N	F	G	F	G	K	G	F	I	D	K	G	H	L	E	P	V	Q	G	R	Q	K	V	E	D	G	L	G	D	L	N	K	P	L	S	N	Q	N	L	V	T	W	K	D	T	P	V	Y	N	A	P	S	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?				?		?					?			?	?						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	A	P	F	G	V	L	A	D	N	L	R	Y	P	I	L	H	K	L	K	D	R	L	N	Q	T	W	Y	Q	I	R	I	G	D	R	L	A	Y	I	S	A	L	D	A	Q	P	D	N	G	L	S	V	L	T	Y	H	H	I	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?		?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	E	E	N	T	R	F	R	H	T	S	T	T	T	S	V	R	A	F	N	N	Q	M	A	W	L	R	D	R	G	Y	A	T	L	S	M	V	Q	L	E	G	Y	V	K	N	K	I	N	L	P	A	R	A	V	V	I	T	F	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	L	K	S	V	S	R	Y	A	Y	P	V	L	K	Q	Y	G	M	K	A	T	A	F	I	V	T	S	R	I	K	R	H	P	Q	K	W	N	P	K	S	L	Q	F	M	S	V	S	E	L	N	E	I	R	D	V	F	D	F	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		H	T	H	F	L	H	R	V	D	G	Y	R	R	P	I	L	L	S	R	S	E	H	N	I	L	F	D	F	A	R	S	R	R	A	L	A	Q	F	N	P	H	V	W	Y	L	S	Y	P	F	G	G	F	N	D	N	A	V	K	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	D	A	G	F	H	L	A	V	T	T	M	K	G	K	V	K	P	G	D	N	P	L	L	L	K	R	L	Y	I	L	R	T	D	S	L	E	T	M	S	R	L	V	S	N	Q	P	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand