Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P14565 Date Wed Jan 25 15:20:38 GMT 2012 Unique Job ID ec7a67129bc5f945

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	M	S	I	A	Q	V	R	S	A	G	S	A	G	N	Y	Y	T	D	K	D	N	Y	Y	V	L	G	S	M	G	E	R	W	A	G	R	G	A	E	Q	L	G	L	Q	G	S	V	D	K	D	V	F	T	R	L	L	E	G	R	L
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?
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Sequence		P	D	G	A	D	L	S	R	M	Q	D	G	S	N	R	H	R	P	G	Y	D	L	T	F	S	A	P	K	S	V	S	M	M	A	M	L	G	G	D	K	R	L	I	D	A	H	N	Q	A	V	D	F	A	V	R	Q	V	E	A	L
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Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		A	S	T	R	V	M	T	D	G	Q	S	E	T	V	L	T	G	N	L	V	M	A	L	F	N	H	D	T	S	R	D	Q	E	P	Q	L	H	T	H	A	V	V	A	N	V	T	Q	H	N	G	E	W	K	T	L	S	S	D	K	V
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Disorder									?	?	?					?																																												?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	K	T	G	F	I	E	N	V	Y	A	N	Q	I	A	F	G	R	L	Y	R	E	K	L	K	E	Q	V	E	A	L	G	Y	E	T	E	V	V	G	K	H	G	M	W	E	M	P	G	V	P	V	E	A	F	S	G	R	S	Q	T
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Disorder		?	?	?																																			?					?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	R	E	A	V	G	E	D	A	S	L	K	S	R	D	V	A	A	L	D	T	R	K	S	K	Q	H	V	D	P	E	I	K	M	A	E	W	M	Q	T	L	K	E	T	G	F	D	I	R	A	Y	R	D	A	A	D	Q	R	A	D
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Disorder							?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	R	T	L	T	P	G	P	A	S	Q	D	G	P	D	V	Q	Q	A	V	T	Q	A	I	A	G	L	S	E	R	K	V	Q	F	T	Y	T	D	V	L	A	R	T	V	G	I	L	P	P	E	N	G	V	I	E	R	A	R	A	G
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	D	E	A	I	S	R	E	Q	L	I	P	L	D	R	E	K	G	L	F	T	S	G	I	H	V	L	D	E	L	S	V	R	A	L	S	R	D	I	M	K	Q	N	R	V	T	V	H	P	E	K	S	V	P	R	T	A	G	Y	S
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	A	V	S	V	L	A	Q	D	R	P	S	L	A	I	V	S	G	Q	G	G	A	A	G	Q	R	E	R	V	A	E	L	V	M	M	A	R	E	Q	G	R	E	V	Q	I	I	A	A	D	R	R	S	Q	M	N	M	K	Q	D	E
Secondary structure
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Disorder												?																																																	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	L	S	G	E	L	I	T	G	R	R	Q	L	L	E	G	M	A	F	T	P	G	S	T	V	I	V	D	Q	G	E	K	L	S	L	K	E	T	L	T	L	L	D	G	A	A	R	H	N	V	Q	V	L	I	T	D	S	G	Q	R
Secondary structure
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Disorder		?	?													?	?	?	?	?		?																																					?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	G	T	G	S	A	L	M	A	M	K	D	A	G	V	N	T	Y	R	W	Q	G	G	E	Q	R	P	A	T	I	I	S	E	P	D	R	N	V	R	Y	A	R	L	A	G	D	F	A	A	S	V	K	A	G	E	E	S	V	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	S	G	V	R	E	Q	A	I	L	T	Q	A	I	R	S	E	L	K	T	Q	G	V	L	G	L	P	E	V	T	M	T	A	L	S	P	V	W	L	D	S	R	S	R	Y	L	R	D	M	Y	R	P	G	M	V	M	E	Q	W	N
Secondary structure
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Disorder																						?	?	?	?	?												?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		P	E	T	R	S	H	D	R	Y	V	I	D	R	V	T	A	Q	S	H	S	L	T	L	R	D	A	Q	G	E	T	Q	V	V	R	I	S	S	L	D	S	S	W	S	L	F	R	P	E	K	M	P	V	A	D	G	E	R	L	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																									?									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	G	K	I	P	G	L	R	V	S	G	G	D	R	L	Q	V	A	S	V	S	E	D	A	M	T	V	V	V	P	G	R	A	E	P	A	T	L	P	V	S	D	S	P	F	T	A	L	K	L	E	N	G	W	V	E	T	P	G	H
Secondary structure
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Disorder						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		S	V	S	D	S	A	T	V	F	A	S	V	T	Q	M	A	M	D	N	A	T	L	N	G	L	A	R	S	G	R	D	V	R	L	Y	S	S	L	D	E	T	R	T	A	E	K	L	A	R	H	P	S	F	T	V	V	S	E	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?		?																																?	?		?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		K	T	R	A	G	E	T	S	L	E	T	A	I	S	H	Q	K	S	A	L	H	T	P	A	Q	Q	A	I	H	L	A	L	P	V	V	E	S	K	K	L	A	F	S	M	V	D	L	L	T	E	A	K	S	F	A	A	E	G	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?																	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		F	T	E	L	G	G	E	I	N	A	Q	I	K	R	G	D	L	L	Y	V	D	V	A	K	G	Y	G	T	G	L	L	V	S	R	A	S	Y	E	A	E	K	S	I	L	R	H	I	L	E	G	K	E	A	V	M	P	L	M	E	R
Secondary structure
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Disorder																								?	?																												?		?
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Sequence		V	P	G	E	L	M	E	K	L	T	S	G	Q	R	A	A	T	R	M	I	L	E	T	S	D	R	F	T	V	V	Q	G	Y	A	G	V	G	K	T	T	Q	F	R	A	V	M	S	A	V	N	M	L	P	E	S	E	R	P	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
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Sequence		V	G	L	G	P	T	H	R	A	V	G	E	M	R	S	A	G	V	D	A	Q	T	L	A	S	F	L	H	D	T	Q	L	Q	Q	R	S	G	E	T	P	D	F	S	N	T	L	F	L	L	D	E	S	S	M	V	G	N	T	D	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		A	R	A	Y	A	L	I	A	A	G	G	G	R	A	V	A	S	G	D	T	D	Q	L	Q	A	I	A	P	G	Q	P	F	R	L	Q	Q	T	R	S	A	A	D	V	A	I	M	K	E	I	V	R	Q	T	P	E	L	R	E	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
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Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?								?	?	?	?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		F	P	D	V	P	M	T	L	Y	E	A	I	V	R	D	Y	T	G	R	T	P	E	A	R	E	Q	T	L	I	V	T	H	L	N	E	D	R	R	V	L	N	S	M	I	H	D	V	R	E	K	A	G	E	L	G	K	E	Q	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		V	P	V	L	N	T	A	N	I	R	D	G	E	L	R	R	L	S	T	W	E	T	H	R	D	A	L	V	L	V	D	N	V	Y	H	R	I	A	G	I	S	K	D	D	G	L	I	T	L	Q	D	A	E	G	N	T	R	L	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		P	R	E	A	V	A	E	G	V	T	L	Y	T	P	D	T	I	R	V	G	T	G	D	R	M	R	F	T	K	S	D	R	E	R	G	Y	V	A	N	S	V	W	T	V	T	A	V	S	G	D	S	V	T	L	S	D	G	Q	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?							?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		R	E	I	R	P	G	Q	E	Q	A	E	Q	H	I	D	L	A	Y	A	I	T	A	H	G	A	Q	G	A	S	E	T	F	A	I	A	L	E	G	T	E	G	N	R	K	L	M	A	G	F	E	S	A	Y	V	A	L	S	R	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																																?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		Q	H	V	Q	V	Y	T	D	N	R	Q	G	W	T	D	A	I	N	N	A	V	Q	K	G	T	A	H	D	V	F	E	P	K	P	D	R	E	V	M	N	A	E	R	L	F	S	T	A	R	E	L	R	D	V	A	A	G	R	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560
Sequence		L	R	Q	A	G	L	A	G	G	D	S	P	A	R	F	I	A	P	G	R	K	Y	P	Q	P	Y	V	A	L	P	A	F	D	R	N	G	K	S	A	G	I	W	L	N	P	L	T	T	D	D	G	N	G	L	R	G	F	S	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?		?	?	?		?		?		?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620
Sequence		G	R	V	K	G	S	G	D	A	Q	F	V	A	L	Q	G	S	R	N	G	E	S	L	L	A	D	N	M	Q	D	G	V	R	I	A	R	D	N	P	D	S	G	V	V	V	R	I	A	G	E	G	R	P	W	N	P	G	A	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?																				?			?	?	?	?			?				?	?	?	?	?	?		?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680
Sequence		G	G	R	V	W	G	D	I	P	D	N	S	V	Q	P	G	A	G	N	G	E	P	V	T	A	E	V	L	A	Q	R	Q	A	E	E	A	I	R	R	E	T	E	R	R	A	D	E	I	V	R	K	M	A	E	N	K	P	D	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?										?									?		?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1740
Sequence		D	G	K	T	E	Q	A	V	R	E	I	A	G	Q	E	R	D	R	A	A	I	T	E	R	E	A	A	L	P	E	G	V	L	R	E	P	Q	R	V	R	E	A	V	R	E	I	A	R	E	N	L	L	Q	E	R	L	Q	Q	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1750	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	D	M	V	R	D	L	Q	K	E	K	T	L	G	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?
Disorder confidence