Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08394 Date Thu Jan 5 11:01:26 GMT 2012 Unique Job ID ec26ad5c8cd5bf72

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	V	A	E	T	L	D	P	L	R	L	P	L	Q	G	E	R	L	I	E	A	S	A	G	T	G	K	T	F	T	I	A	A	L	Y	L	R	L	L	L	G	L	G	G	S	A	A	F	P	R	P	L	T	V	E	E	L	L
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?			?																																			?	?	?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	V	T	F	T	E	A	A	T	A	E	L	R	G	R	I	R	S	N	I	H	E	L	R	I	A	C	L	R	E	T	T	D	N	P	L	Y	E	R	L	L	E	E	I	D	D	K	A	Q	A	A	Q	W	L	L	L	A	E	R	Q
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	D	E	A	A	V	F	T	I	H	G	F	C	Q	R	M	L	N	L	N	A	F	E	S	G	M	L	F	E	Q	Q	L	I	E	D	E	S	L	L	R	Y	Q	A	C	A	D	F	W	R	R	H	C	Y	P	L	P	R	E	I	A
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Sequence		Q	V	V	F	E	T	W	K	G	P	Q	A	L	L	R	D	I	N	R	Y	L	Q	G	E	A	P	V	I	K	A	P	P	P	D	D	E	T	L	A	S	R	H	A	Q	I	V	A	R	I	D	T	V	K	Q	Q	W	R	D	A	V
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	E	L	D	A	L	I	E	S	S	G	I	D	R	R	K	F	N	R	S	N	Q	A	K	W	I	D	K	I	S	A	W	A	E	E	E	T	N	S	Y	Q	L	P	E	S	L	E	K	F	S	Q	R	F	L	E	D	R	T	K	A
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	G	E	T	P	R	H	P	L	F	E	A	I	D	Q	L	L	A	E	P	L	S	I	R	D	L	V	I	T	R	A	L	A	E	I	R	E	T	V	A	R	E	K	R	R	R	G	E	L	G	F	D	D	M	L	S	R	L	D	S
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	R	S	E	S	G	E	V	L	A	A	A	I	R	T	R	F	P	V	A	M	I	D	E	F	Q	D	T	D	P	Q	Q	Y	R	I	F	R	R	I	W	H	H	Q	P	E	T	A	L	L	L	I	G	D	P	K	Q	A	I	Y
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Sequence		A	F	R	G	A	D	I	F	T	Y	M	K	A	R	S	E	V	H	A	H	Y	T	L	D	T	N	W	R	S	A	P	G	M	V	N	S	V	N	K	L	F	S	Q	T	D	D	A	F	M	F	R	E	I	P	F	I	P	V	K	S
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Sequence		A	G	K	N	Q	A	L	R	F	V	F	K	G	E	T	Q	P	A	M	K	M	W	L	M	E	G	E	S	C	G	V	G	D	Y	Q	S	T	M	A	Q	V	C	A	A	Q	I	R	D	W	L	Q	A	G	Q	R	G	E	A	L	L
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Disorder		?																										?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		M	N	G	D	D	A	R	P	V	R	A	S	D	I	S	V	L	V	R	S	R	Q	E	A	A	Q	V	R	D	A	L	T	L	L	E	I	P	S	V	Y	L	S	N	R	D	S	V	F	E	T	L	E	A	Q	E	M	L	W	L	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	A	V	M	T	P	E	R	E	N	T	L	R	S	A	L	A	T	S	M	M	G	L	N	A	L	D	I	E	T	L	N	N	D	E	H	A	W	D	V	V	V	E	E	F	D	G	Y	R	Q	I	W	R	K	R	G	V	M	P	M
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Sequence		L	R	A	L	M	S	A	R	N	I	A	E	N	L	L	A	T	A	G	G	E	R	R	L	T	D	I	L	H	I	S	E	L	L	Q	E	A	G	T	Q	L	E	S	E	H	A	L	V	R	W	L	S	Q	H	I	L	E	P	D	S
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		N	A	S	S	Q	Q	M	R	L	E	S	D	K	H	L	V	Q	I	V	T	I	H	K	S	K	G	L	E	Y	P	L	V	W	L	P	F	I	T	N	F	R	V	Q	E	Q	A	F	Y	H	D	R	H	S	F	E	A	V	L	D	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		N	A	A	P	E	S	V	D	L	A	E	A	E	R	L	A	E	D	L	R	L	L	Y	V	A	L	T	R	S	V	W	H	C	S	L	G	V	A	P	L	V	R	R	R	G	D	K	K	G	D	T	D	V	H	Q	S	A	L	G	R
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Sequence		L	L	Q	K	G	E	P	Q	D	A	A	G	L	R	T	C	I	E	A	L	C	D	D	D	I	A	W	Q	T	A	Q	T	G	D	N	Q	P	W	Q	V	N	D	V	S	T	A	E	L	N	A	K	T	L	Q	R	L	P	G	D	N
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		W	R	V	T	S	Y	S	G	L	Q	Q	R	G	H	G	I	A	Q	D	L	M	P	R	L	D	V	D	A	A	G	V	A	S	V	V	E	E	P	T	L	T	P	H	Q	F	P	R	G	A	S	P	G	T	F	L	H	S	L	F	E
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Disorder				?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		D	L	D	F	T	Q	P	V	D	P	N	W	V	R	E	K	L	E	L	G	G	F	E	S	Q	W	E	P	V	L	T	E	W	I	T	A	V	L	Q	A	P	L	N	E	T	G	V	S	L	S	Q	L	S	A	R	N	K	Q	V	E
Secondary structure
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Disorder																																														?								?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		M	E	F	Y	L	P	I	S	E	P	L	I	A	S	Q	L	D	T	L	I	R	Q	F	D	P	L	S	A	G	C	P	P	L	E	F	M	Q	V	R	G	M	L	K	G	F	I	D	L	V	F	R	H	E	G	R	Y	Y	L	L	D
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Disorder										?	?	?															?	?	?	?			?					?	?
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Sequence		Y	K	S	N	W	L	G	E	D	S	S	A	Y	T	Q	Q	A	M	A	A	A	M	Q	A	H	R	Y	D	L	Q	Y	Q	L	Y	T	L	A	L	H	R	Y	L	R	H	R	I	A	D	Y	D	Y	E	H	H	F	G	G	V	I	Y
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Sequence		L	F	L	R	G	V	D	K	E	H	P	Q	Q	G	I	Y	T	T	R	P	N	A	G	L	I	A	L	M	D	E	M	F	A	G	M	T	L	E	E	A
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Disorder									?																										?	?	?	?	?	?	?
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