Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG67 Date Thu Jan 5 11:28:15 GMT 2012 Unique Job ID eb7653506385a79a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	E	S	F	A	Q	L	F	E	E	S	L	K	E	I	E	T	R	P	G	S	I	V	R	G	V	V	V	A	I	D	K	D	V	V	L	V	D	A	G	L	K	S	E	S	A	I	P	A	E	Q	F	K	N	A	Q	G	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?												?	?	?	?	?	?																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	I	Q	V	G	D	E	V	D	V	A	L	D	A	V	E	D	G	F	G	E	T	L	L	S	R	E	K	A	K	R	H	E	A	W	I	T	L	E	K	A	Y	E	D	A	E	T	V	T	G	V	I	N	G	K	V	K	G	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	V	E	L	N	G	I	R	A	F	L	P	G	S	L	V	D	V	R	P	V	R	D	T	L	H	L	E	G	K	E	L	E	F	K	V	I	K	L	D	Q	K	R	N	N	V	V	V	S	R	R	A	V	I	E	S	E	N	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?			?																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	R	D	Q	L	L	E	N	L	Q	E	G	M	E	V	K	G	I	V	K	N	L	T	D	Y	G	A	F	V	D	L	G	G	V	D	G	L	L	H	I	T	D	M	A	W	K	R	V	K	H	P	S	E	I	V	N	V	G	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	T	V	K	V	L	K	F	D	R	E	R	T	R	V	S	L	G	L	K	Q	L	G	E	D	P	W	V	A	I	A	K	R	Y	P	E	G	T	K	L	T	G	R	V	T	N	L	T	D	Y	G	C	F	V	E	I	E	E	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?					?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	G	L	V	H	V	S	E	M	D	W	T	N	K	N	I	H	P	S	K	V	V	N	V	G	D	V	V	E	V	M	V	L	D	I	D	E	E	R	R	R	I	S	L	G	L	K	Q	C	K	A	N	P	W	Q	Q	F	A	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		H	N	K	G	D	R	V	E	G	K	I	K	S	I	T	D	F	G	I	F	I	G	L	D	G	G	I	D	G	L	V	H	L	S	D	I	S	W	N	V	A	G	E	E	A	V	R	E	Y	K	K	G	D	E	I	A	A	V	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	V	D	A	E	R	E	R	I	S	L	G	V	K	Q	L	A	E	D	P	F	N	N	W	V	A	L	N	K	K	G	A	I	V	T	G	K	V	T	A	V	D	A	K	G	A	T	V	E	L	A	D	G	V	E	G	Y	L	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	E	A	S	R	D	R	V	E	D	A	T	L	V	L	S	V	G	D	E	V	E	A	K	F	T	G	V	D	R	K	N	R	A	I	S	L	S	V	R	A	K	D	E	A	D	E	K	D	A	I	A	T	V	N	K	Q	E	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	F	S	N	N	A	M	A	E	A	F	K	A	A	K	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?										?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand