Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32710 Date Thu Jan 5 11:50:29 GMT 2012 Unique Job ID ea62dd73d23ec419

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	T	P	L	T	A	F	A	G	V	R	L	R	W	P	A	M	M	R	L	T	C	I	G	I	L	A	Q	F	A	L	L	L	L	A	F	G	V	L	T	Y	C	F	L	I	S	D	F	S	V	I	Y	V	A	Q	H	S	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	L	S	W	E	L	K	L	A	A	V	W	G	G	H	E	G	S	L	L	L	W	V	L	L	L	S	A	W	S	A	L	F	A	W	H	Y	R	Q	Q	T	D	P	L	F	P	L	T	L	A	V	L	S	L	M	L	A	A	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	F	V	V	L	W	S	D	P	F	V	R	I	F	P	P	A	I	E	G	R	D	L	N	P	M	L	Q	H	P	G	L	I	F	H	P	P	L	L	Y	L	G	Y	G	G	L	M	V	A	A	S	V	A	L	A	S	L	L	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	F	D	G	A	C	A	R	I	C	W	R	W	A	L	P	G	W	S	A	L	T	A	G	I	I	L	G	S	W	W	A	Y	C	E	L	G	W	G	G	W	W	F	W	D	P	V	E	N	A	S	L	L	P	W	L	S	A	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	L	H	S	L	S	L	T	R	Q	R	G	I	F	C	H	W	S	L	L	L	A	I	V	T	L	M	L	S	L	L	G	T	L	I	V	R	S	G	I	L	V	S	V	H	A	F	A	L	D	N	V	R	A	V	P	L	F	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	A	L	I	S	L	A	S	L	A	L	Y	G	W	R	A	R	D	G	G	P	A	V	H	F	S	G	L	S	R	E	M	L	I	L	A	T	L	L	L	F	C	A	V	L	L	I	V	L	V	G	T	L	Y	P	M	I	Y	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	G	W	G	R	L	S	V	G	A	P	Y	F	N	R	A	T	L	P	F	G	L	L	M	L	V	V	I	V	L	A	T	F	V	S	G	K	R	V	Q	L	P	A	L	V	A	H	A	G	V	L	L	F	A	A	G	V	V	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?			?																											?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	V	S	R	Q	E	I	S	L	N	L	Q	P	G	Q	Q	V	T	L	A	G	Y	T	F	R	F	E	C	L	D	L	Q	A	K	G	N	Y	T	S	E	K	A	I	V	A	L	F	D	H	Q	Q	R	I	G	E	L	T	P	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?								?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	F	Y	E	A	R	R	Q	Q	M	M	E	P	S	I	R	W	N	G	I	H	D	W	Y	A	V	M	G	E	K	T	G	P	D	R	Y	A	F	R	L	Y	V	Q	S	G	V	R	W	I	W	G	G	G	L	L	M	I	A	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Sequence		L	L	S	G	W	R	G	K	K	R	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand