Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31440 Date Thu Jan 5 11:47:30 GMT 2012 Unique Job ID ea340db96a41ad1b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	N	D	N	T	D	Y	V	S	N	E	S	G	T	L	S	R	L	F	K	L	P	Q	H	G	T	T	V	R	T	E	L	I	A	G	M	T	T	F	L	T	M	V	Y	I	V	F	V	N	P	Q	I	L	G	A	A	Q	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?																														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	K	V	V	F	V	T	T	C	L	I	A	G	I	G	S	I	A	M	G	I	F	A	N	L	P	V	A	L	A	P	A	M	G	L	N	A	F	F	A	F	V	V	V	G	A	M	G	I	S	W	Q	T	G	M	G	A	I	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																							?			?	?	?	?	?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	A	V	G	L	F	L	L	T	L	F	R	I	R	Y	W	M	I	S	N	I	P	L	S	L	R	I	G	I	T	S	G	I	G	L	F	I	A	L	M	G	L	K	N	T	G	V	I	V	A	N	K	D	T	L	V	M	I	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	S	S	H	G	V	L	L	G	I	L	G	F	F	I	I	T	V	L	S	S	R	H	F	H	A	A	V	L	V	S	I	V	V	T	S	C	C	G	L	F	F	G	D	V	H	F	S	G	V	Y	S	I	P	P	D	I	S	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?					?		?			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	G	E	V	D	L	S	G	A	L	T	L	E	L	A	G	I	I	F	S	F	M	L	I	N	L	F	D	S	S	G	T	L	I	G	V	T	D	K	A	G	L	I	D	G	N	G	K	F	P	N	M	N	K	A	L	Y	V	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?		?		?	?		?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	S	S	V	A	G	A	F	I	G	T	S	S	V	T	A	Y	I	E	S	T	S	G	V	A	V	G	G	R	T	G	L	T	A	V	V	V	G	V	M	F	L	L	V	M	F	F	S	P	L	V	A	I	V	P	P	Y	A	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?				?	?	?		?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	A	L	I	F	V	G	V	L	M	T	S	S	L	A	R	V	N	W	D	D	F	T	E	S	V	P	A	F	I	T	T	V	M	M	P	F	T	F	S	I	T	E	G	I	A	L	G	F	M	S	Y	C	I	M	K	V	C	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Sequence		R	W	R	D	L	N	L	C	V	V	V	V	A	A	L	F	A	L	K	I	I	L	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand