Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P27253 Date Thu Jan 5 11:43:33 GMT 2012 Unique Job ID e9a796d14d3bb0a9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	N	V	Q	E	W	Q	Q	L	A	N	K	E	L	S	R	R	E	K	T	V	D	S	L	V	H	Q	T	A	E	G	I	A	I	K	P	L	Y	T	E	A	D	L	D	N	L	E	V	T	G	T	L	P	G	L	P	P	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?	?																														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	G	P	R	A	T	M	Y	T	A	Q	P	W	T	I	R	Q	Y	A	G	F	S	T	A	K	E	S	N	A	F	Y	R	R	N	L	A	A	G	Q	K	G	L	S	V	A	F	D	L	A	T	H	R	G	Y	D	S	D	N	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	A	G	D	V	G	K	A	G	V	A	I	D	T	V	E	D	M	K	V	L	F	D	Q	I	P	L	D	K	M	S	V	S	M	T	M	N	G	A	V	L	P	V	L	A	F	Y	I	V	A	A	E	E	Q	G	V	T	P	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	T	G	T	I	Q	N	D	I	L	K	E	Y	L	C	R	N	T	Y	I	Y	P	P	K	P	S	M	R	I	I	A	D	I	I	A	W	C	S	G	N	M	P	R	F	N	T	I	S	I	S	G	Y	H	M	G	E	A	G	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	V	Q	Q	V	A	F	T	L	A	D	G	I	E	Y	I	K	A	A	I	S	A	G	L	K	I	D	D	F	A	P	R	L	S	F	F	F	G	I	G	M	D	L	F	M	N	V	A	M	L	R	A	A	R	Y	L	W	S	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	S	G	F	G	A	Q	D	P	K	S	L	A	L	R	T	H	C	Q	T	S	G	W	S	L	T	E	Q	D	P	Y	N	N	V	I	R	T	T	I	E	A	L	A	A	T	L	G	G	T	Q	S	L	H	T	N	A	F	D	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	G	L	P	T	D	F	S	A	R	I	A	R	N	T	Q	I	I	I	Q	E	E	S	E	L	C	R	T	V	D	P	L	A	G	S	Y	Y	I	E	S	L	T	D	Q	I	V	K	Q	A	R	A	I	I	Q	Q	I	D	E	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	M	A	K	A	I	E	A	G	L	P	K	R	M	I	E	E	A	S	A	R	E	Q	S	L	I	D	Q	G	K	R	V	I	V	G	V	N	K	Y	K	L	D	H	E	D	E	T	D	V	L	E	I	D	N	V	M	V	R	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	I	A	S	L	E	R	I	R	A	T	R	D	D	A	A	V	T	A	A	L	N	A	L	T	H	A	A	Q	H	N	E	N	L	L	A	A	A	V	N	A	A	R	V	R	A	T	L	G	E	I	S	D	A	L	E	V	A	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?											?	?												?																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	Y	L	V	P	S	Q	C	V	T	G	V	I	A	Q	S	Y	H	Q	S	E	K	S	A	S	E	F	D	A	I	V	A	Q	T	E	Q	F	L	A	D	N	G	R	R	P	R	I	L	I	A	K	M	G	Q	D	G	H	D	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?		?	?	?																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	K	V	I	A	S	A	Y	S	D	L	G	F	D	V	D	L	S	P	M	F	S	T	P	E	E	I	A	R	L	A	V	E	N	D	V	H	V	V	G	A	S	S	L	A	A	G	H	K	T	L	I	P	E	L	V	E	A	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Sequence		K	W	G	R	E	D	I	C	V	V	A	G	G	V	I	P	P	Q	D	Y	A	F	L	Q	E	R	G	V	A	A	I	Y	G	P	G	T	P	M	L	D	S	V	R	D	V	L	N	L	I	S	Q	H	H	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand