Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33235 Date Thu Jan 5 11:51:35 GMT 2012 Unique Job ID e95323781f8300b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	L	I	N	N	A	M	S	G	L	N	A	A	Q	A	A	L	N	T	A	S	N	N	I	S	S	Y	N	V	A	G	Y	T	R	Q	T	T	I	M	A	Q	A	N	S	T	L	G	A	G	G	W	V	G	N	G	V	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																				?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	G	V	Q	R	E	Y	D	A	F	I	T	N	Q	L	R	A	A	Q	T	Q	S	S	G	L	T	A	R	Y	E	Q	M	S	K	I	D	N	M	L	S	T	S	T	S	S	L	A	T	Q	M	Q	D	F	F	T	S	L	Q	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	S	N	A	E	D	P	A	A	R	Q	A	L	I	G	K	S	E	G	L	V	N	Q	F	K	T	T	D	Q	Y	L	R	D	Q	D	K	Q	V	N	I	A	I	G	A	S	V	D	Q	I	N	N	Y	A	K	Q	I	A	S	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	Q	I	S	R	L	T	G	V	G	A	G	A	S	P	N	N	L	L	D	Q	R	D	Q	L	V	S	E	L	N	Q	I	V	G	V	E	V	S	V	Q	D	G	G	T	Y	N	I	T	M	A	N	G	Y	S	L	V	Q	G	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	R	Q	L	A	A	V	P	S	S	A	D	P	S	R	T	T	V	A	Y	V	D	G	T	A	G	N	I	E	I	P	E	K	L	L	N	T	G	S	L	G	G	I	L	T	F	R	S	Q	D	L	D	Q	T	R	N	T	L	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	L	A	F	A	E	A	F	N	T	Q	H	K	A	G	F	D	A	N	G	D	A	G	E	D	F	F	A	I	G	K	P	A	V	L	Q	N	T	K	N	K	G	D	V	A	I	G	A	T	V	T	D	A	S	A	V	L	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?			?	?			?								?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	Y	K	I	S	F	D	N	N	Q	W	Q	V	T	R	L	A	S	N	T	T	F	T	V	T	P	D	A	N	G	K	V	A	F	D	G	L	E	L	T	F	T	G	T	P	A	V	N	D	S	F	T	L	K	P	V	S	D	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?			?	?			?	?	?	?								?		?	?		?	?	?	?	?	?	?					?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	N	M	D	V	L	I	T	D	E	A	K	I	A	M	A	S	E	E	D	A	G	D	S	D	N	R	N	G	Q	A	L	L	D	L	Q	S	N	S	K	T	V	G	G	A	K	S	F	N	D	A	Y	A	S	L	V	S	D	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	K	T	A	T	L	K	T	S	S	A	T	Q	G	N	V	V	T	Q	L	S	N	Q	Q	Q	S	I	S	G	V	N	L	D	E	E	Y	G	N	L	Q	R	F	Q	Q	Y	Y	L	A	N	A	Q	V	L	Q	T	A	N	A	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		D	A	L	I	N	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand