Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGF4 Date Thu Jan 5 11:28:58 GMT 2012 Unique Job ID e921f1771acff438

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	T	Q	Y	N	S	S	Y	I	F	S	I	T	L	V	A	T	L	G	G	L	L	F	G	Y	D	T	A	V	I	S	G	T	V	E	S	L	N	T	V	F	V	A	P	Q	N	L	S	E	S	A	A	N	S	L	L	G	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																						?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	A	S	A	L	I	G	C	I	I	G	G	A	L	G	G	Y	C	S	N	R	F	G	R	R	D	S	L	K	I	A	A	V	L	F	F	I	S	G	V	G	S	A	W	P	E	L	G	F	T	S	I	N	P	D	N	T	V	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	L	A	G	Y	V	P	E	F	V	I	Y	R	I	I	G	G	I	G	V	G	L	A	S	M	L	S	P	M	Y	I	A	E	L	A	P	A	H	I	R	G	K	L	V	S	F	N	Q	F	A	I	I	F	G	Q	L	L	V	Y	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	N	Y	F	I	A	R	S	G	D	A	S	W	L	N	T	D	G	W	R	Y	M	F	A	S	E	C	I	P	A	L	L	F	L	M	L	L	Y	T	V	P	E	S	P	R	W	L	M	S	R	G	K	Q	E	Q	A	E	G	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	K	I	M	G	N	T	L	A	T	Q	A	V	Q	E	I	K	H	S	L	D	H	G	R	K	T	G	G	R	L	L	M	F	G	V	G	V	I	V	I	G	V	M	L	S	I	F	Q	Q	F	V	G	I	N	V	V	L	Y	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	E	V	F	K	T	L	G	A	S	T	D	I	A	L	L	Q	T	I	I	V	G	V	I	N	L	T	F	T	V	L	A	I	M	T	V	D	K	F	G	R	K	P	L	Q	I	I	G	A	L	G	M	A	I	G	M	F	S	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	A	F	Y	T	Q	A	P	G	I	V	A	L	L	S	M	L	F	Y	V	A	A	F	A	M	S	W	G	P	V	C	W	V	L	L	S	E	I	F	P	N	A	I	R	G	K	A	L	A	I	A	V	A	A	Q	W	L	A	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	V	S	W	T	F	P	M	M	D	K	N	S	W	L	V	A	H	F	H	N	G	F	S	Y	W	I	Y	G	C	M	G	V	L	A	A	L	F	M	W	K	F	V	P	E	T	K	G	K	T	L	E	E	L	E	A	L	W	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Sequence		E	T	K	K	T	Q	Q	T	A	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand