Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P19318 Date Thu Jan 5 11:37:15 GMT 2012 Unique Job ID e7e5ca19dfd4a59e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	I	R	S	Q	V	G	M	V	L	N	L	D	K	C	I	G	C	H	T	C	S	V	T	C	K	N	V	W	T	G	R	E	G	M	E	Y	A	W	F	N	N	V	E	T	K	P	G	I	G	Y	P	K	N	W	E	D	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																								?	?															?												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	W	Q	G	G	W	V	R	D	V	N	G	K	I	R	P	R	L	G	N	K	M	G	V	I	T	K	I	F	A	N	P	V	V	P	Q	I	D	D	Y	Y	E	P	F	T	F	D	Y	E	H	L	H	S	A	P	E	G	K	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?	?				?		?				?			?	?	?								?		?	?	?	?		?	?			?		?	?		?											?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	T	A	R	P	R	S	L	I	D	G	K	R	M	D	K	V	I	W	G	P	N	W	E	E	L	L	G	G	E	F	E	K	R	A	R	D	R	N	F	E	A	M	Q	K	E	M	Y	G	Q	F	E	N	T	F	M	M	Y	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	L	C	E	H	C	L	N	P	S	C	V	A	T	C	P	S	G	A	I	Y	K	R	E	E	D	G	I	V	L	I	D	Q	D	K	C	R	G	W	R	L	C	I	S	G	C	P	Y	K	K	I	Y	F	N	W	K	S	G	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	K	C	I	F	C	Y	P	R	I	E	S	G	Q	P	T	V	C	S	E	T	C	V	G	R	I	R	Y	L	G	V	L	L	Y	D	A	D	R	I	E	E	A	A	S	T	E	R	E	V	D	L	Y	E	R	Q	C	E	V	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?		?					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	P	H	D	P	S	V	I	E	E	A	L	K	Q	G	I	P	Q	N	V	I	D	A	A	Q	R	S	P	V	Y	K	M	A	M	D	W	K	L	A	L	P	L	H	P	E	Y	R	T	L	P	M	V	W	Y	V	P	P	L	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?				?	?			?	?	?	?			?		?					?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	Q	S	Y	A	D	A	G	G	L	P	K	S	E	G	V	L	P	A	I	E	S	L	R	I	P	V	Q	Y	L	A	N	M	L	S	A	G	D	T	G	P	V	L	R	A	L	K	R	M	M	A	M	R	H	Y	M	R	S	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?														?	?																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	E	G	V	T	D	T	R	A	I	D	E	V	G	L	S	V	A	Q	V	E	E	M	Y	R	Y	L	A	I	A	N	Y	E	D	R	F	V	I	P	T	S	H	R	E	M	A	G	D	A	F	A	E	R	N	G	C	G	F	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?							?	?	?	?																																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Sequence		G	D	G	C	H	G	S	D	S	K	F	N	L	F	N	S	S	R	I	D	A	I	N	I	T	E	V	R	D	K	A	E	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand