Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P96329 Date Thu Jan 5 12:33:17 GMT 2012 Unique Job ID e7c9d1a54d564f10

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	I	L	R	Q	L	W	N	Q	K	G	L	D	A	A	V	E	D	V	P	E	D	R	Y	G	F	G	N	I	A	E	N	I	S	R	S	I	L	T	L	P	L	E	A	S	N	V	V	G	I	E	G	A	W	G	S	G	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?		?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	L	L	N	L	I	L	R	N	L	A	L	K	K	D	A	H	T	H	V	L	H	I	S	P	W	L	S	G	G	S	P	V	E	A	L	F	L	P	V	A	T	V	I	Q	Q	E	M	E	I	R	Y	P	P	K	G	F	K	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?		?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	R	K	Y	L	L	S	P	E	A	Q	K	V	I	E	Y	A	Q	D	T	S	S	R	V	L	P	L	V	Q	Y	I	G	Q	F	S	S	I	I	N	W	I	A	G	G	I	K	V	F	S	D	S	R	L	A	V	D	Q	K	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?											?	?						?			?	?				?								?	?	?	?				?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	K	L	R	A	E	I	A	G	Q	L	V	S	L	D	L	K	F	I	V	V	M	D	D	L	D	R	L	E	P	S	Q	V	A	E	V	F	R	L	V	R	A	V	A	D	L	P	R	F	T	H	I	L	C	Y	D	R	Q	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	H	A	V	E	H	A	L	N	I	E	D	G	S	R	Y	L	Q	K	I	I	Q	L	S	F	K	L	P	R	P	E	A	F	D	L	R	N	E	F	R	Q	R	A	E	A	L	Y	Q	Q	I	N	N	Q	P	P	D	S	G	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?	?	?	?	?																																								?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	D	L	I	A	V	T	D	T	Y	G	A	A	L	S	T	P	R	E	I	H	Q	A	I	N	S	L	I	F	L	Y	P	G	M	R	D	F	V	Y	F	P	D	L	C	L	L	Q	L	I	R	V	T	N	P	A	L	Y	D	W	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	H	Y	L	T	E	R	S	V	I	E	T	G	Q	G	M	L	S	D	G	E	K	A	D	F	R	E	G	L	I	R	C	M	K	T	F	R	A	S	N	A	D	S	F	L	T	L	A	D	W	I	P	G	I	S	G	H	N	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?				?																	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	L	N	L	F	E	P	V	S	E	D	F	R	H	I	Q	T	T	G	K	R	L	S	S	L	T	H	W	R	Y	Y	F	A	F	S	S	P	Q	N	V	L	P	P	E	F	F	R	Q	L	F	E	Q	A	G	V	S	E	K	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?				?	?						?																			?	?	?	?																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	L	S	E	L	L	L	S	K	I	N	S	V	G	S	L	S	G	T	W	F	E	H	I	L	S	R	L	T	P	G	L	I	R	E	R	N	F	E	E	C	A	G	L	V	H	F	F	F	D	H	T	D	E	V	S	T	R	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?																?	?	?	?	?																				?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	R	N	P	W	F	S	L	R	E	M	A	I	N	E	V	V	R	H	L	L	K	H	M	Q	D	I	D	E	T	R	T	I	T	L	M	E	K	L	I	V	T	G	A	S	P	F	W	I	A	D	F	M	R	D	L	I	W	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?			?																			?		?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	L	A	Q	N	A	V	P	S	P	S	D	A	L	F	S	R	D	I	T	E	R	L	R	D	R	F	A	E	R	M	N	Q	P	E	L	Q	Q	Q	L	L	L	R	K	S	L	L	G	Y	L	Y	A	W	R	D	M	S	S	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	V	K	Q	W	V	R	E	V	T	T	T	D	E	G	L	V	N	L	L	I	R	L	Q	T	S	V	F	S	S	H	R	G	A	Y	R	R	I	A	R	D	Q	V	S	P	F	F	D	D	W	P	A	V	E	E	K	L	K	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
Sequence		L	S	G	N	E	L	T	P	E	Q	E	A	L	K	T	A	L	E	N	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?											?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand