Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG90 Date Thu Jan 5 11:28:27 GMT 2012 Unique Job ID e786438c150c8220

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	N	R	Y	P	L	W	K	Y	V	M	L	I	V	V	I	V	I	G	L	L	Y	A	L	P	N	L	F	G	E	D	P	A	V	Q	I	T	G	A	R	G	V	A	A	S	E	Q	T	L	I	Q	V	Q	K	T	L	Q	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																			?	?	?	?		?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	I	T	A	K	S	V	A	L	E	E	G	A	I	L	A	R	F	D	S	T	D	T	Q	L	R	A	R	E	A	L	M	G	V	M	G	D	K	Y	V	V	A	L	N	L	A	P	A	T	P	R	W	L	A	A	I	H	A	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	K	L	G	L	D	L	R	G	G	V	H	F	L	M	E	V	D	M	D	T	A	L	G	K	L	Q	E	Q	N	I	D	S	L	R	S	D	L	R	E	K	G	I	P	Y	T	T	V	R	K	E	N	N	Y	G	L	S	I	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																							?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	D	A	K	A	R	D	E	A	I	A	Y	L	S	K	R	H	P	D	L	V	I	S	S	Q	G	S	N	Q	L	R	A	V	M	S	D	A	R	L	S	E	A	R	E	Y	A	V	Q	Q	N	I	N	I	L	R	N	R	V	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?										?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	G	V	A	E	P	V	V	Q	R	Q	G	A	D	R	I	V	V	E	L	P	G	I	Q	D	T	A	R	A	K	E	I	L	G	A	T	A	T	L	E	F	R	L	V	N	T	N	V	D	Q	A	A	A	A	S	G	R	V	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?		?	?				?	?	?	?	?								?													?					?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	S	E	V	K	Q	T	R	E	G	Q	P	V	V	L	Y	K	R	V	I	L	T	G	D	H	I	T	D	S	T	S	S	Q	D	E	Y	N	Q	P	Q	V	N	I	S	L	D	S	A	G	G	N	I	M	S	N	F	T	K	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?						?			?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	G	K	P	M	A	T	L	F	V	E	Y	K	D	S	G	K	K	D	A	N	G	R	A	V	L	V	K	Q	E	E	V	I	N	I	A	N	I	Q	S	R	L	G	N	S	F	R	I	T	G	I	N	N	P	N	E	A	R	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?									?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	L	L	L	R	A	G	A	L	I	A	P	I	Q	I	V	E	E	R	T	I	G	P	T	L	G	M	Q	N	I	E	Q	G	L	E	A	C	L	A	G	L	L	V	S	I	L	F	M	I	I	F	Y	K	K	F	G	L	I	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	A	L	I	A	N	L	I	L	I	V	G	I	M	S	L	L	P	G	A	T	L	S	M	P	G	I	A	G	I	V	L	T	L	A	V	A	V	D	A	N	V	L	I	N	E	R	I	K	E	E	L	S	N	G	R	T	V	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	I	D	E	G	Y	R	G	A	F	S	S	I	F	D	A	N	I	T	T	L	I	K	V	I	I	L	Y	A	V	G	T	G	A	I	K	G	F	A	I	T	T	G	I	G	V	A	T	S	M	F	T	A	I	V	G	T	R	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Sequence		V	N	L	L	Y	G	G	K	R	V	K	K	L	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand