Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ADN0 Date Thu Jan 5 11:21:24 GMT 2012 Unique Job ID e6e8f29af940bf92

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	T	L	D	T	L	N	V	M	L	A	V	S	E	E	G	L	I	E	E	M	I	I	A	L	L	A	S	P	Q	L	A	V	F	F	E	K	F	P	R	L	K	A	A	I	T	D	D	V	P	R	W	R	E	A	L	R	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?											?														?										?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	K	D	A	R	V	P	P	E	L	T	E	E	V	M	C	Y	Q	Q	S	Q	L	L	S	T	P	Q	F	I	V	Q	L	P	Q	I	L	D	L	L	H	R	L	N	S	P	W	A	E	Q	A	R	Q	L	V	D	A	N	S	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																			?	?	?	?																				?													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	S	A	L	H	T	L	F	L	Q	R	W	R	L	S	L	I	V	Q	A	T	T	L	N	Q	Q	L	L	E	E	E	R	E	Q	L	L	S	E	V	Q	E	R	M	T	L	S	G	Q	L	E	P	I	L	A	D	N	N	T	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																	?	?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	R	L	W	D	M	S	A	G	Q	L	K	R	G	D	Y	Q	L	I	V	K	Y	G	E	F	L	N	E	Q	P	E	L	K	R	L	A	E	Q	L	G	R	S	R	E	A	K	S	I	P	R	N	D	A	Q	M	E	T	F	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?					?		?	?	?	?	?													?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	V	R	E	P	A	T	V	P	E	Q	V	D	G	L	Q	Q	S	D	D	I	L	R	L	L	P	P	E	L	A	T	L	G	I	T	E	L	E	Y	E	F	Y	R	R	L	V	E	K	Q	L	L	T	Y	R	L	H	G	E	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	E	K	V	I	E	R	P	V	V	H	K	D	Y	D	E	Q	P	R	G	P	F	I	V	C	V	D	T	S	G	S	M	G	G	F	N	E	Q	C	A	K	A	F	C	L	A	L	M	R	I	A	L	A	E	N	R	R	C	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	L	F	S	T	E	I	V	R	Y	E	L	S	G	P	Q	G	I	E	Q	A	I	R	F	L	S	Q	Q	F	R	G	G	T	D	L	A	S	C	F	R	A	I	M	E	R	L	Q	S	R	E	W	F	D	A	D	A	V	V	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	F	I	A	Q	R	L	P	D	D	V	T	S	K	V	K	E	L	Q	R	V	H	Q	H	R	F	H	A	V	A	M	S	A	H	G	K	P	G	I	M	R	I	F	D	H	I	W	R	F	D	T	G	M	R	S	R	L	L	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?				?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		W	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand