Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P69786 Date Thu Jan 5 12:11:53 GMT 2012 Unique Job ID e67944bfeadeb084

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	K	N	A	F	A	N	L	Q	K	V	G	K	S	L	M	L	P	V	S	V	L	P	I	A	G	I	L	L	G	V	G	S	A	N	F	S	W	L	P	A	V	V	S	H	V	M	A	E	A	G	G	S	V	F	A	N	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	I	F	A	I	G	V	A	L	G	F	T	N	N	D	G	V	S	A	L	A	A	V	V	A	Y	G	I	M	V	K	T	M	A	V	V	A	P	L	V	L	H	L	P	A	E	E	I	A	S	K	H	L	A	D	T	G	V	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	I	I	S	G	A	I	A	A	Y	M	F	N	R	F	Y	R	I	K	L	P	E	Y	L	G	F	F	A	G	K	R	F	V	P	I	I	S	G	L	A	A	I	F	T	G	V	V	L	S	F	I	W	P	P	I	G	S	A	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	F	S	Q	W	A	A	Y	Q	N	P	V	V	A	F	G	I	Y	G	F	I	E	R	C	L	V	P	F	G	L	H	H	I	W	N	V	P	F	Q	M	Q	I	G	E	Y	T	N	A	A	G	Q	V	F	H	G	D	I	P	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	G	D	P	T	A	G	K	L	S	G	G	F	L	F	K	M	Y	G	L	P	A	A	A	I	A	I	W	H	S	A	K	P	E	N	R	A	K	V	G	G	I	M	I	S	A	A	L	T	S	F	L	T	G	I	T	E	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	F	S	F	M	F	V	A	P	I	L	Y	I	I	H	A	I	L	A	G	L	A	F	P	I	C	I	L	L	G	M	R	D	G	T	S	F	S	H	G	L	I	D	F	I	V	L	S	G	N	S	S	K	L	W	L	F	P	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	I	G	Y	A	I	V	Y	Y	T	I	F	R	V	L	I	K	A	L	D	L	K	T	P	G	R	E	D	A	T	E	D	A	K	A	T	G	T	S	E	M	A	P	A	L	V	A	A	F	G	G	K	E	N	I	T	N	L	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		C	I	T	R	L	R	V	S	V	A	D	V	S	K	V	D	Q	A	G	L	K	K	L	G	A	A	G	V	V	V	A	G	S	G	V	Q	A	I	F	G	T	K	S	D	N	L	K	T	E	M	D	E	Y	I	R	N	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																																								?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand