Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P71298 Date Thu Jan 5 12:12:44 GMT 2012 Unique Job ID e643feabdf2c74b4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	I	P	S	I	Y	L	H	Q	Q	L	H	Y	C	K	T	A	I	L	N	W	S	R	K	M	A	L	S	R	Q	K	F	T	F	E	R	L	R	R	F	T	L	P	E	G	K	K	Q	T	F	L	W	D	A	D	V	T	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?			?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	C	R	A	T	S	G	A	K	A	F	V	F	Q	S	V	Y	A	G	K	T	L	R	M	T	I	G	N	I	N	D	W	K	I	D	D	A	R	A	E	A	R	R	L	Q	T	L	I	D	T	G	I	D	P	R	I	A	K	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	I	A	E	A	E	S	L	Q	A	E	S	R	K	T	K	V	T	F	S	V	A	W	E	D	Y	L	Q	E	L	R	T	G	I	S	A	K	T	K	R	P	Y	S	T	R	Y	I	A	D	H	I	N	L	S	S	R	G	G	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																			?	?		?	?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	K	R	G	Q	G	P	T	S	A	G	P	L	A	S	L	L	N	L	P	L	S	E	L	T	P	D	Y	I	A	A	W	L	S	T	E	R	Q	N	R	P	T	V	T	A	H	A	Y	R	L	L	R	A	F	I	K	W	S	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?			?																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	K	K	Y	Q	G	I	I	P	G	D	L	A	Q	D	Y	N	V	R	K	M	V	P	V	S	A	S	K	A	D	D	C	L	Q	K	E	Q	L	K	S	W	F	S	A	V	R	S	L	N	N	P	I	A	S	A	Y	L	Q	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	T	G	A	R	R	E	E	I	A	S	L	R	W	S	D	V	D	F	K	W	S	S	M	R	I	K	D	K	I	E	G	E	R	I	I	P	L	T	P	Y	V	S	E	L	L	N	V	L	A	Q	S	P	N	S	D	V	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	G	W	V	F	R	S	N	S	K	S	G	K	I	I	E	P	R	S	A	H	N	R	A	L	V	L	A	E	L	P	H	I	S	L	H	G	L	R	R	S	F	G	T	L	A	E	W	V	E	V	P	T	G	I	V	A	Q	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	H	K	P	S	A	L	A	E	K	H	Y	R	R	R	P	L	D	L	L	R	K	W	H	E	K	I	E	T	W	I	L	N	E	A	G	I	T	I	K	N	N	V	D	M	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand