Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q06067 Date Thu Jan 5 12:33:25 GMT 2012 Unique Job ID e476e983d4dea314

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	Y	M	K	W	I	Y	P	R	R	L	R	N	Q	M	I	L	M	A	I	L	M	V	I	V	P	T	L	T	I	G	Y	I	V	E	T	E	G	R	S	A	V	L	S	E	K	E	K	K	L	S	A	V	V	N	L	L	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	G	D	R	Y	D	L	Y	I	D	L	P	R	E	E	R	I	R	A	L	N	A	E	L	A	P	I	T	E	N	I	T	H	A	F	P	G	I	G	A	G	Y	Y	N	K	M	L	D	A	I	I	T	Y	A	P	S	A	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	N	N	V	G	V	T	I	A	A	D	H	P	G	R	E	V	M	R	T	N	T	P	L	V	Y	S	G	R	Q	V	R	G	D	I	L	N	S	M	L	P	I	E	R	N	G	E	I	L	G	Y	I	W	A	N	E	L	T	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?							?	?		?	?	?	?	?			?	?	?	?			?			?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	R	R	Q	A	W	K	M	D	V	R	I	I	I	V	L	T	A	G	L	L	I	S	L	L	L	I	V	L	F	S	R	R	L	S	A	N	I	D	I	I	T	D	G	L	S	T	L	A	Q	N	I	P	T	R	L	P	Q	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	E	M	G	Q	I	S	Q	S	V	N	N	L	A	Q	A	L	R	E	T	R	T	L	N	D	L	I	I	E	N	A	A	D	G	V	I	A	I	D	R	Q	G	D	V	T	T	M	N	P	A	A	E	V	I	T	G	Y	Q	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	L	V	G	Q	P	Y	S	M	L	F	D	N	T	Q	F	Y	S	P	V	L	D	T	L	E	H	G	T	E	H	V	A	L	E	I	S	F	P	G	R	D	R	T	I	E	L	S	V	T	T	S	R	I	H	N	T	H	G	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	G	A	L	V	I	F	S	D	L	T	A	R	K	E	T	Q	R	R	M	A	Q	A	E	R	L	A	T	L	G	E	L	M	A	G	V	A	H	E	V	R	N	P	L	T	A	I	R	G	Y	V	Q	I	L	R	Q	Q	T	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	I	H	Q	E	Y	L	S	V	V	L	K	E	I	D	S	I	N	K	V	I	Q	Q	L	L	E	F	S	R	P	R	H	S	Q	W	Q	Q	V	S	L	N	A	L	V	E	E	T	L	V	L	V	Q	T	A	G	V	Q	A	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	F	I	S	E	L	D	N	E	L	S	P	I	N	A	D	R	E	L	L	K	Q	V	L	L	N	I	L	I	N	A	V	Q	A	I	S	A	R	G	K	I	R	I	Q	T	W	Q	Y	S	D	S	Q	Q	A	I	S	I	E	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	C	G	I	D	L	S	L	Q	K	K	I	F	D	P	F	F	T	T	K	A	S	G	T	G	L	G	L	A	L	S	Q	R	I	I	N	A	H	Q	G	D	I	R	V	A	S	L	P	G	Y	G	A	T	F	T	L	I	L	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	P	Q	G	N	Q	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand