Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07017 Date Thu Jan 5 11:00:02 GMT 2012 Unique Job ID e43c6b1d80074314

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	N	R	I	R	V	V	T	L	L	V	M	V	L	G	V	F	A	L	L	Q	L	I	S	G	S	L	F	F	S	S	L	H	H	S	Q	K	S	F	V	V	S	N	Q	L	R	E	Q	Q	G	E	L	T	S	T	W	D	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	Q	T	R	I	N	L	S	R	S	A	V	R	M	M	M	D	S	S	N	Q	Q	S	N	A	K	V	E	L	L	D	S	A	R	K	T	L	A	Q	A	A	T	H	Y	K	K	F	K	S	M	A	P	L	P	E	M	V	A	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	N	I	D	E	K	Y	K	N	Y	Y	T	A	L	T	E	L	I	D	Y	L	D	Y	G	N	T	G	A	Y	F	A	Q	P	T	Q	G	M	Q	N	A	M	G	E	A	F	A	Q	Y	A	L	S	S	E	K	L	Y	R	D	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?		?							?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	D	N	A	D	D	Y	R	F	A	Q	W	Q	L	A	V	I	A	L	V	V	V	L	I	L	L	V	A	W	Y	G	I	R	R	M	L	L	T	P	L	A	K	I	I	A	H	I	R	E	I	A	G	G	N	L	A	N	T	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	D	G	R	S	E	M	G	D	L	A	Q	S	V	S	H	M	Q	R	S	L	T	D	T	V	T	H	V	R	E	G	S	D	A	I	Y	A	G	T	R	E	I	A	A	G	N	T	D	L	S	S	R	T	E	Q	Q	A	S	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	E	T	A	A	S	M	E	Q	L	T	A	T	V	K	Q	N	A	D	N	A	R	Q	A	S	Q	L	A	Q	S	A	S	D	T	A	Q	H	G	G	K	V	V	D	G	V	V	K	T	M	H	E	I	A	D	S	S	K	K	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	I	I	S	V	I	D	G	I	A	F	Q	T	N	I	L	A	L	N	A	A	V	E	A	A	R	A	G	E	Q	G	R	G	F	A	V	V	A	G	E	V	R	N	L	A	S	R	S	A	Q	A	A	K	E	I	K	A	L	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	S	V	S	R	V	D	T	G	S	V	L	V	E	S	A	G	E	T	M	N	N	I	V	N	A	V	T	R	V	T	D	I	M	G	E	I	A	S	A	S	D	E	Q	S	R	G	I	D	Q	V	A	L	A	V	S	E	M	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	T	Q	Q	N	A	S	L	V	Q	E	S	A	A	A	A	A	A	L	E	E	Q	A	S	R	L	T	Q	A	V	S	A	F	R	L	A	A	S	P	L	T	N	K	P	Q	T	P	S	R	P	A	S	E	Q	P	P	A	Q	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Sequence		L	R	I	A	E	Q	D	P	N	W	E	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand