Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFA2 Date Thu Jan 5 11:25:43 GMT 2012 Unique Job ID e3eb0a205f73273e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	R	C	L	S	P	L	T	L	V	N	Q	V	A	L	I	V	L	L	S	T	A	I	G	L	A	G	M	A	V	S	G	W	L	V	Q	G	V	Q	G	S	A	H	A	I	N	K	A	G	S	L	R	M	Q	S	Y	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	A	A	V	P	L	S	E	K	D	K	P	L	I	K	E	M	E	Q	T	A	F	S	A	E	L	T	R	A	A	E	R	D	G	Q	L	A	Q	L	Q	G	L	Q	D	Y	W	R	N	E	L	I	P	A	L	M	R	A	Q	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?			?	?	?																	?				?		?																				?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	T	V	S	A	D	V	S	Q	F	V	A	G	L	D	Q	L	V	S	G	F	D	R	T	T	E	M	R	I	E	T	V	V	L	V	H	R	V	M	A	V	F	M	A	L	L	L	V	F	T	I	I	W	L	R	A	R	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	W	R	Q	L	L	A	M	A	S	A	V	S	H	R	D	F	T	Q	R	A	N	I	S	G	R	N	E	M	A	M	L	G	T	A	L	N	N	M	S	A	E	L	A	E	S	Y	A	V	L	E	Q	R	V	Q	E	K	T	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	E	H	K	N	Q	I	L	S	F	L	W	Q	A	N	R	R	L	H	S	R	A	P	L	C	E	R	L	S	P	V	L	N	G	L	Q	N	L	T	L	L	R	D	I	E	L	R	V	Y	D	T	D	D	E	E	N	H	Q	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	C	Q	P	D	M	T	C	D	D	K	G	C	Q	L	C	P	R	G	V	L	P	V	G	D	R	G	T	T	L	K	W	R	L	A	D	S	H	T	Q	Y	G	I	L	L	A	T	L	P	Q	G	R	H	L	S	H	D	Q	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	V	D	T	L	V	E	Q	L	T	A	T	L	A	L	D	R	H	Q	E	R	Q	Q	Q	L	I	V	M	E	E	R	A	T	I	A	R	E	L	H	D	S	I	A	Q	S	L	S	C	M	K	M	Q	V	S	C	L	Q	M	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	A	L	P	E	S	S	R	E	L	L	S	Q	I	R	N	E	L	N	A	S	W	A	Q	L	R	E	L	L	T	T	F	R	L	Q	L	T	E	P	G	L	R	P	A	L	E	A	S	C	E	E	Y	S	A	K	F	G	F	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	L	D	Y	Q	L	P	P	R	L	V	P	S	H	Q	A	I	H	L	L	Q	I	A	R	E	A	L	S	N	A	L	K	H	S	Q	A	S	E	V	V	V	T	V	A	Q	N	D	N	Q	V	K	L	T	V	Q	D	N	G	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	P	E	N	A	I	R	S	N	H	Y	G	M	I	I	M	R	D	R	A	Q	S	L	R	G	D	C	R	V	R	R	R	E	S	G	G	T	E	V	V	V	T	F	I	P	E	K	T	F	T	D	V	Q	G	D	T	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand