Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P05791 Date Thu Jan 5 10:58:53 GMT 2012 Unique Job ID e21c08d3f378458b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	K	Y	R	S	A	T	T	T	H	G	R	N	M	A	G	A	R	A	L	W	R	A	T	G	M	T	D	A	D	F	G	K	P	I	I	A	V	V	N	S	F	T	Q	F	V	P	G	H	V	H	L	R	D	L	G	K	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	E	Q	I	E	A	A	G	G	V	A	K	E	F	N	T	I	A	V	D	D	G	I	A	M	G	H	G	G	M	L	Y	S	L	P	S	R	E	L	I	A	D	S	V	E	Y	M	V	N	A	H	C	A	D	A	M	V	C	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	C	D	K	I	T	P	G	M	L	M	A	S	L	R	L	N	I	P	V	I	F	V	S	G	G	P	M	E	A	G	K	T	K	L	S	D	Q	I	I	K	L	D	L	V	D	A	M	I	Q	G	A	D	P	K	V	S	D	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?				?											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	D	Q	V	E	R	S	A	C	P	T	C	G	S	C	S	G	M	F	T	A	N	S	M	N	C	L	T	E	A	L	G	L	S	Q	P	G	N	G	S	L	L	A	T	H	A	D	R	K	Q	L	F	L	N	A	G	K	R	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	L	T	K	R	Y	Y	E	Q	N	D	E	S	A	L	P	R	N	I	A	S	K	A	A	F	E	N	A	M	T	L	D	I	A	M	G	G	S	T	N	T	V	L	H	L	L	A	A	A	Q	E	A	E	I	D	F	T	M	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	D	K	L	S	R	K	V	P	Q	L	C	K	V	A	P	S	T	Q	K	Y	H	M	E	D	V	H	R	A	G	G	V	I	G	I	L	G	E	L	D	R	A	G	L	L	N	R	D	V	K	N	V	L	G	L	T	L	P	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	E	Q	Y	D	V	M	L	T	Q	D	D	A	V	K	N	M	F	R	A	G	P	A	G	I	R	T	T	Q	A	F	S	Q	D	C	R	W	D	T	L	D	D	D	R	A	N	G	C	I	R	S	L	E	H	A	Y	S	K	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	L	A	V	L	Y	G	N	F	A	E	N	G	C	I	V	K	T	A	G	V	D	D	S	I	L	K	F	T	G	P	A	K	V	Y	E	S	Q	D	D	A	V	E	A	I	L	G	G	K	V	V	A	G	D	V	V	V	I	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	G	P	K	G	G	P	G	M	Q	E	M	L	Y	P	T	S	F	L	K	S	M	G	L	G	K	A	C	A	L	I	T	D	G	R	F	S	G	G	T	S	G	L	S	I	G	H	V	S	P	E	A	A	S	G	G	S	I	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	E	D	G	D	L	I	A	I	D	I	P	N	R	G	I	Q	L	Q	V	S	D	A	E	L	A	A	R	R	E	A	Q	D	A	R	G	D	K	A	W	T	P	K	N	R	E	R	Q	V	S	F	A	L	R	A	Y	A	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	S	A	D	K	G	A	V	R	D	K	S	K	L	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?				?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand