Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23367 Date Thu Jan 5 11:39:26 GMT 2012 Unique Job ID e19466b908b9e767

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	I	Q	V	L	P	P	Q	L	A	N	Q	I	A	A	G	E	V	V	E	R	P	A	S	V	V	K	E	L	V	E	N	S	L	D	A	G	A	T	R	I	D	I	D	I	E	R	G	G	A	K	L	I	R	I	R	D	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	G	I	K	K	D	E	L	A	L	A	L	A	R	H	A	T	S	K	I	A	S	L	D	D	L	E	A	I	I	S	L	G	F	R	G	E	A	L	A	S	I	S	S	V	S	R	L	T	L	T	S	R	T	A	E	Q	Q	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	Q	A	Y	A	E	G	R	D	M	N	V	T	V	K	P	A	A	H	P	V	G	T	T	L	E	V	L	D	L	F	Y	N	T	P	A	R	R	K	F	L	R	T	E	K	T	E	F	N	H	I	D	E	I	I	R	R	I	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	R	F	D	V	T	I	N	L	S	H	N	G	K	I	V	R	Q	Y	R	A	V	P	E	G	G	Q	K	E	R	R	L	G	A	I	C	G	T	A	F	L	E	Q	A	L	A	I	E	W	Q	H	G	D	L	T	L	R	G	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	D	P	N	H	T	T	P	A	L	A	E	I	Q	Y	C	Y	V	N	G	R	M	M	R	D	R	L	I	N	H	A	I	R	Q	A	C	E	D	K	L	G	A	D	Q	Q	P	A	F	V	L	Y	L	E	I	D	P	H	Q	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	N	V	H	P	A	K	H	E	V	R	F	H	Q	S	R	L	V	H	D	F	I	Y	Q	G	V	L	S	V	L	Q	Q	Q	L	E	T	P	L	P	L	D	D	E	P	Q	P	A	P	R	S	I	P	E	N	R	V	A	A	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		N	H	F	A	E	P	A	A	R	E	P	V	A	P	R	Y	T	P	A	P	A	S	G	S	R	P	A	A	P	W	P	N	A	Q	P	G	Y	Q	K	Q	Q	G	E	V	Y	R	Q	L	L	Q	T	P	A	P	M	Q	K	L	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?				?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	E	P	Q	E	P	A	L	A	A	N	S	Q	S	F	G	R	V	L	T	I	V	H	S	D	C	A	L	L	E	R	D	G	N	I	S	L	L	S	L	P	V	A	E	R	W	L	R	Q	A	Q	L	T	P	G	E	A	P	V	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?							?	?	?		?																																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	Q	P	L	L	I	P	L	R	L	K	V	S	A	E	E	K	S	A	L	E	K	A	Q	S	A	L	A	E	L	G	I	D	F	Q	S	D	A	Q	H	V	T	I	R	A	V	P	L	P	L	R	Q	Q	N	L	Q	I	L	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	L	I	G	Y	L	A	K	Q	S	V	F	E	P	G	N	I	A	Q	W	I	A	R	N	L	M	S	E	H	A	Q	W	S	M	A	Q	A	I	T	L	L	A	D	V	E	R	L	C	P	Q	L	V	K	T	P	P	G	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Sequence		Q	S	V	D	L	H	P	A	I	K	A	L	K	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand