Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77437 Date Thu Jan 5 12:29:18 GMT 2012 Unique Job ID df3a97ad84902093

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Y	S	V	M	F	A	L	L	L	L	T	P	L	L	F	S	L	L	C	F	A	C	R	K	R	R	L	S	A	T	R	T	V	T	V	L	H	S	L	G	I	T	L	L	L	I	L	A	L	W	V	V	Q	T	A	A	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																							?	?	?																									?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	E	I	F	A	A	G	L	W	L	H	I	D	G	L	G	G	L	F	L	A	I	L	G	V	I	G	F	L	T	G	I	Y	S	I	G	Y	M	R	H	E	V	A	H	G	E	L	S	P	V	T	L	C	D	Y	Y	G	F	F	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	F	L	F	T	M	L	L	V	V	T	S	N	N	L	I	V	M	W	A	A	I	E	A	T	T	L	S	S	A	F	L	V	G	I	Y	G	Q	R	S	S	L	E	A	A	W	K	Y	I	I	I	C	T	V	G	V	A	F	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	G	T	V	L	V	Y	A	N	A	A	S	V	M	P	Q	A	E	M	A	I	F	W	S	E	V	L	K	Q	S	S	L	L	D	P	T	L	M	L	L	A	F	V	F	L	L	I	G	F	G	T	K	T	G	L	F	P	M	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	L	P	D	A	H	S	E	A	P	S	P	V	S	A	L	L	S	A	V	L	L	N	C	A	L	L	V	L	I	R	Y	Y	I	I	I	C	Q	A	I	G	S	D	F	P	N	R	L	L	L	I	F	G	M	L	S	V	A	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	F	F	I	L	V	Q	R	D	I	K	R	L	L	A	Y	S	S	V	E	N	M	G	L	V	A	V	E	L	G	I	G	G	P	L	G	I	F	A	A	L	L	H	I	L	N	H	S	L	A	K	T	L	L	F	C	G	S	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	L	L	K	Y	G	T	R	D	L	N	V	V	C	G	M	L	K	I	M	P	F	T	A	V	L	F	G	G	G	A	L	A	L	A	G	M	P	P	F	N	I	F	L	S	E	F	M	T	I	T	A	G	L	A	R	N	H	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	I	V	L	L	L	L	L	L	T	L	V	L	A	G	L	V	R	M	A	A	R	V	L	M	A	K	P	P	Q	A	V	N	R	G	D	L	G	W	L	T	T	S	P	M	V	I	L	L	V	M	M	L	A	M	G	T	H	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	P	V	I	R	I	L	A	G	A	S	T	I	V	L	S	G	T	H	D	L	P	A	Q	R	S	T	W	H	D	F	L	P	S	G	T	A	S	V	S	E	K	H	S	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?		?				?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand