Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77694 Date Thu Jan 5 12:31:44 GMT 2012 Unique Job ID dea2b89a0ac83a3f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	V	N	L	L	I	T	M	I	I	F	A	L	I	W	P	V	T	A	L	R	A	A	V	S	K	T	T	W	A	D	A	P	A	R	E	F	V	F	V	E	N	N	S	D	D	N	F	F	V	T	P	G	G	A	L	D	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	T	G	A	N	R	W	T	G	L	K	Y	T	G	S	G	T	I	Y	Q	Q	S	L	G	Y	I	D	N	G	Y	N	T	G	L	Y	T	N	W	K	F	D	M	W	L	E	N	S	P	V	S	S	P	L	T	G	L	R	C	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	Y	A	G	C	N	M	T	T	S	L	I	L	P	Q	T	T	D	A	S	G	F	Y	G	A	T	V	T	S	G	G	A	K	W	M	H	G	M	L	S	D	A	F	Y	Q	Y	M	Q	Q	M	P	V	G	S	S	F	T	M	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?												?				?		?		?	?	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	A	C	Q	T	S	V	N	Y	D	A	S	S	G	A	R	C	K	D	Q	A	S	G	N	W	Y	V	R	N	V	T	H	T	K	A	A	N	L	R	L	I	N	T	H	S	L	A	E	V	F	I	N	S	D	G	V	P	T	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?		?	?			?			?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?								?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	G	N	A	D	C	R	T	Q	T	I	G	S	R	S	G	L	S	C	K	M	V	N	Y	T	L	Q	T	N	G	L	S	N	T	S	I	H	I	F	P	A	I	A	N	S	S	L	A	S	A	V	G	A	Y	D	M	Q	F	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?																	?														?		?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	G	S	S	W	K	P	V	S	N	T	A	Y	Y	Y	T	F	N	E	M	K	S	A	D	S	I	Y	V	F	F	S	S	N	F	F	K	Q	M	V	N	L	G	I	S	D	I	N	T	K	D	L	F	N	F	R	F	Q	N	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	P	E	S	G	W	Y	E	F	S	T	S	N	T	L	I	I	K	P	R	D	F	S	I	S	I	I	S	D	E	Y	T	Q	T	P	S	R	E	G	Y	V	G	S	G	E	S	A	L	D	F	G	Y	I	V	T	T	S	G	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?																		?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	A	D	E	V	L	I	K	V	T	G	P	A	Q	V	I	G	G	R	S	Y	C	V	F	S	S	D	D	G	K	A	K	V	P	F	P	A	T	L	S	F	I	T	R	N	G	A	T	K	T	Y	D	A	G	C	D	D	S	W	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?								?	?	?	?	?	?	?																											?	?		?	?	?		?		?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	M	T	D	A	L	W	L	T	T	P	W	T	D	I	S	G	E	V	G	Q	M	D	K	T	T	V	K	F	S	I	P	M	D	N	A	I	S	L	R	T	V	D	D	N	G	W	F	G	E	V	S	A	S	G	E	I	H	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	T	W	R	N	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand