Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76330 Date Thu Jan 5 12:21:53 GMT 2012 Unique Job ID de78e33ef15407a0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	H	E	T	K	M	E	N	Q	S	W	L	K	K	L	A	R	R	L	G	P	G	H	V	V	N	L	C	F	I	V	V	L	L	F	S	T	L	L	T	W	R	E	V	V	V	L	E	D	A	Y	I	S	S	Q	R	N	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?																						?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	N	V	A	N	A	L	D	K	H	L	Q	Y	N	V	D	K	L	I	F	L	R	N	G	M	R	E	A	L	V	A	P	L	D	F	T	S	L	R	D	A	V	T	E	F	E	Q	H	R	D	E	H	A	W	K	I	E	L	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?																								?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	R	T	L	P	V	N	G	V	S	D	A	L	V	S	E	G	N	L	L	S	R	E	N	E	S	L	D	N	E	I	T	A	A	L	E	V	G	Y	L	L	R	L	A	H	N	S	S	S	M	V	E	Q	A	M	Y	V	S	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?									?	?								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	F	Y	V	S	T	Q	P	T	L	F	T	R	N	V	P	T	R	Y	Y	G	Y	V	T	Q	P	W	F	I	G	H	S	Q	R	E	N	R	H	R	A	V	R	W	F	T	S	Q	P	E	H	A	S	N	T	E	P	Q	V	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?							?	?	?	?	?																						?	?		?		?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	V	P	V	D	S	N	N	Y	W	Y	G	V	L	G	M	S	I	P	V	R	T	M	Q	Q	F	L	R	N	A	I	D	K	N	L	D	G	E	Y	Q	L	Y	D	S	K	L	R	F	L	T	S	S	N	P	D	H	P	T	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	F	D	P	R	E	L	A	L	L	A	Q	A	M	E	H	D	T	R	G	G	I	R	M	D	S	R	Y	V	S	W	E	R	L	D	H	F	D	G	V	L	V	R	V	H	T	L	S	E	G	V	R	G	D	F	G	S	I	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?		?	?	?	?	?																										?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	T	L	L	W	A	L	F	T	T	M	L	L	I	S	W	Y	V	I	R	R	M	V	S	N	M	Y	V	L	Q	S	S	L	Q	W	Q	A	W	H	D	T	L	T	R	L	Y	N	R	G	A	L	F	E	K	A	R	P	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	L	C	Q	T	H	Q	H	P	F	S	V	I	Q	V	D	L	D	H	F	K	A	I	N	D	R	F	G	H	Q	A	G	D	R	V	L	S	H	A	A	G	L	I	S	S	S	L	R	A	Q	D	V	A	G	R	V	G	G	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	C	V	I	L	P	G	A	S	L	T	E	A	A	E	V	A	E	R	I	R	L	K	L	N	E	K	E	M	L	I	A	K	S	T	T	I	R	I	S	A	S	L	G	V	S	S	S	E	E	T	G	D	Y	D	F	E	Q	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Sequence		S	L	A	D	R	R	L	Y	L	A	K	Q	A	G	R	N	R	V	F	A	S	D	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand