Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77536 Date Thu Jan 5 12:30:20 GMT 2012 Unique Job ID de4088acefc71732

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	I	K	T	S	N	T	D	F	K	T	R	I	R	Q	Q	I	E	D	P	I	M	R	K	A	V	A	N	A	Q	Q	R	I	G	A	N	R	Q	K	M	V	D	E	L	G	H	W	E	E	W	R	D	R	A	A	Q	I	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	V	L	S	N	L	D	A	Y	L	Y	Q	L	S	E	K	V	T	Q	N	G	G	H	V	Y	F	A	R	T	K	E	D	A	T	R	Y	I	L	Q	V	A	Q	R	K	N	A	R	K	V	V	K	S	K	S	M	V	T	E	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	V	N	H	V	L	Q	D	A	G	I	Q	V	I	E	T	D	L	G	E	Y	I	L	Q	L	D	Q	D	P	P	S	H	V	V	V	P	A	I	H	K	D	R	H	Q	I	R	R	V	L	H	E	R	L	G	Y	E	G	P	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	E	A	M	T	L	F	I	R	Q	K	I	R	E	D	F	L	S	A	E	I	G	I	T	G	C	N	F	A	V	A	E	T	G	S	V	C	L	V	T	N	E	G	N	A	R	M	C	T	T	L	P	K	T	H	I	A	V	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	E	R	I	A	P	T	F	A	E	V	D	V	L	I	T	M	L	A	R	S	A	V	G	A	R	L	T	G	Y	N	T	W	L	T	G	P	R	E	A	G	H	V	D	G	P	E	E	F	H	L	V	I	V	D	N	G	R	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	A	S	E	F	R	D	V	L	R	C	I	R	C	G	A	C	M	N	T	C	P	A	Y	R	H	I	G	G	H	G	Y	G	S	I	Y	P	G	P	I	G	A	V	I	S	P	L	L	G	G	Y	K	D	F	K	D	L	P	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	C	S	L	C	T	A	C	D	N	V	C	P	V	R	I	P	L	S	K	L	I	L	R	H	R	R	V	M	A	E	K	G	I	T	A	K	A	E	Q	R	A	I	K	M	F	A	Y	A	N	S	H	P	G	L	W	K	V	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Sequence		M	A	G	A	H	A	A	S	W	F	I	N	G	G	K	T	P	L	K	F	G	A	I	S	D	W	M	E	A	R	D	L	P	E	A	D	G	E	S	F	R	S	W	F	K	K	H	Q	A	Q	E	K	K	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?				?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?														?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand