Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P43672 Date Wed Jan 25 15:20:54 GMT 2012 Unique Job ID dc95e703354d6304

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	L	I	S	M	H	G	A	W	L	S	F	S	D	A	P	L	L	D	N	A	E	L	H	I	E	D	N	E	R	V	C	L	V	G	R	N	G	A	G	K	S	T	L	M	K	I	L	N	R	E	Q	G	L	D	D	G	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?																																											?	?		?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	Y	E	Q	D	L	I	V	A	R	L	Q	Q	D	P	P	R	N	V	E	G	S	V	Y	D	F	V	A	E	G	I	E	E	Q	A	E	Y	L	K	R	Y	H	D	I	S	R	L	V	M	N	D	P	S	E	K	N	L	N	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	K	V	Q	E	Q	L	D	H	H	N	L	W	Q	L	E	N	R	I	N	E	V	L	A	Q	L	G	L	D	P	N	V	A	L	S	S	L	S	G	G	W	L	R	K	A	A	L	G	R	A	L	V	S	N	P	R	V	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	E	P	T	N	H	L	D	I	E	T	I	D	W	L	E	G	F	L	K	T	F	N	G	T	I	I	F	I	S	H	D	R	S	F	I	R	N	M	A	T	R	I	V	D	L	D	R	G	K	L	V	T	Y	P	G	N	Y	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	L	L	E	K	E	E	A	L	R	V	E	E	L	Q	N	A	E	F	D	R	K	L	A	Q	E	E	V	W	I	R	Q	G	I	K	A	R	R	T	R	N	E	G	R	V	R	A	L	K	A	M	R	R	E	R	G	E	R	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	M	G	T	A	K	M	Q	V	E	E	A	S	R	S	G	K	I	V	F	E	M	E	D	V	C	Y	Q	V	N	G	K	Q	L	V	K	D	F	S	A	Q	V	L	R	G	D	K	I	A	L	I	G	P	N	G	C	G	K	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	L	K	L	M	L	G	Q	L	Q	A	D	S	G	R	I	H	V	G	T	K	L	E	V	A	Y	F	D	Q	H	R	A	E	L	D	P	D	K	T	V	M	D	N	L	A	E	G	K	Q	E	V	M	V	N	G	K	P	R	H	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																								?	?	?		?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	G	Y	L	Q	D	F	L	F	H	P	K	R	A	M	T	P	V	R	A	L	S	G	G	E	R	N	R	L	L	L	A	R	L	F	L	K	P	S	N	L	L	I	L	D	E	P	T	N	D	L	D	V	E	T	L	E	L	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	L	I	D	S	Y	Q	G	T	V	L	L	V	S	H	D	R	Q	F	V	D	N	T	V	T	E	C	W	I	F	E	G	G	G	K	I	G	R	Y	V	G	G	Y	H	D	A	R	G	Q	Q	E	Q	Y	V	A	L	K	Q	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	K	K	T	E	E	A	A	A	A	K	A	E	T	V	K	R	S	S	S	K	L	S	Y	K	L	Q	R	E	L	E	Q	L	P	Q	L	L	E	D	L	E	A	K	L	E	A	L	Q	T	Q	V	A	D	A	S	F	F	S	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?																																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Sequence		H	E	Q	T	Q	K	V	L	A	D	M	A	A	A	E	Q	E	L	E	Q	A	F	E	R	W	E	Y	L	E	A	L	K	N	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand