Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P46481 Date Wed Jan 25 15:20:56 GMT 2012 Unique Job ID dc4bad30a7568adb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	I	F	S	I	A	N	Q	H	I	R	F	A	V	K	L	A	T	A	I	V	L	A	L	F	V	G	F	H	F	Q	L	E	T	P	R	W	A	V	L	T	A	A	I	V	A	A	G	T	A	F	A	A	G	G	E	P	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	A	I	R	Y	R	G	F	L	R	I	I	G	T	F	I	G	C	I	A	G	L	V	I	I	I	A	M	I	R	A	P	L	L	M	I	L	V	C	C	I	W	A	G	F	C	T	W	I	S	S	L	V	R	I	E	N	S	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	G	L	A	G	Y	T	A	L	I	I	V	I	T	I	Q	P	E	P	L	L	T	P	Q	F	A	V	E	R	C	S	E	I	V	I	G	I	V	C	A	I	M	A	D	L	L	F	S	P	R	S	I	K	Q	E	V	D	R	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	S	L	L	V	A	Q	Y	Q	L	M	Q	L	C	I	K	H	G	D	G	E	V	V	D	K	A	W	G	D	L	V	R	R	T	T	A	L	Q	G	M	R	S	N	L	N	M	E	S	S	R	W	A	R	A	N	R	R	L	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	N	T	L	S	L	T	L	I	T	Q	S	C	E	T	Y	L	I	Q	N	T	R	P	E	L	I	T	D	T	F	R	E	F	F	D	T	P	V	E	T	A	Q	D	V	H	K	Q	L	K	R	L	R	R	V	I	A	W	T	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	E	T	P	V	T	I	Y	S	W	V	A	A	A	T	R	Y	Q	L	L	K	R	G	V	I	S	N	T	K	I	N	A	T	E	E	E	I	L	Q	G	E	P	E	V	K	V	E	S	A	E	R	H	H	A	M	V	N	F	W	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	T	L	S	C	I	L	G	T	L	F	W	L	W	T	G	W	T	S	G	S	G	A	M	V	M	I	A	V	V	T	S	L	A	M	R	L	P	N	P	R	M	V	A	I	D	F	I	Y	G	T	L	A	A	L	P	L	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	F	L	V	I	I	P	N	T	Q	Q	S	M	L	L	L	C	I	S	L	A	V	L	G	F	F	L	G	I	E	V	Q	K	R	R	L	G	S	M	G	A	L	A	S	T	I	N	I	I	V	L	D	N	P	M	T	F	H	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?		?															?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	F	L	D	S	A	L	G	Q	I	V	G	C	V	L	A	F	T	V	I	L	L	V	R	D	K	S	R	D	R	T	G	R	V	L	L	N	Q	F	V	S	A	A	V	S	A	M	T	T	N	V	A	R	R	K	E	N	H	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	L	Y	Q	Q	L	F	L	L	M	N	K	F	P	G	D	L	P	K	F	R	L	A	L	T	M	I	I	A	H	Q	R	L	R	D	A	P	I	P	V	N	E	D	L	S	A	F	H	R	Q	M	R	R	T	A	D	H	V	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Sequence		A	R	S	D	D	K	R	R	R	Y	F	G	Q	L	L	E	E	L	E	I	Y	Q	E	K	L	R	I	W	Q	A	P	P	Q	V	T	E	P	V	N	R	L	A	G	M	L	H	K	Y	Q	H	A	L	T	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand