Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52599 Date Thu Jan 5 12:05:49 GMT 2012 Unique Job ID dbda989f6ec30ca4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	Q	I	N	S	N	K	K	H	S	N	R	R	K	Y	F	S	L	L	A	V	V	L	F	I	A	F	S	G	A	Y	A	Y	W	S	M	E	L	E	D	M	I	S	T	D	D	A	Y	V	T	G	N	A	D	P	I	S	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	S	G	S	V	T	V	V	N	H	K	D	T	N	Y	V	R	Q	G	D	I	L	V	S	L	D	K	T	D	A	T	I	A	L	N	K	A	K	N	N	L	A	N	I	V	R	Q	T	N	K	L	Y	L	Q	D	K	Q	Y	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	V	A	S	A	R	I	Q	Y	Q	Q	S	L	E	D	Y	N	R	R	V	P	L	A	K	Q	G	V	I	S	K	E	T	L	E	H	T	K	D	T	L	I	S	S	K	A	A	L	N	A	A	I	Q	A	Y	K	A	N	K	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	M	N	T	P	L	N	R	Q	P	Q	V	V	E	A	A	D	A	T	K	E	A	W	L	A	L	K	R	T	D	I	K	S	P	V	T	G	Y	I	A	Q	R	S	V	Q	V	G	E	T	V	S	P	G	Q	S	L	M	A	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	A	R	Q	M	W	V	N	A	N	F	K	E	T	Q	L	T	D	V	R	I	G	Q	S	V	N	I	I	S	D	L	Y	G	E	N	V	V	F	H	G	R	V	T	G	I	N	M	G	T	G	N	A	F	S	L	L	P	A	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	T	G	N	W	I	K	I	V	Q	R	V	P	V	E	V	S	L	D	P	K	E	L	M	E	H	P	L	R	I	G	L	S	M	T	A	T	I	D	T	K	N	E	D	I	A	E	M	P	E	L	A	S	T	V	T	S	M	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																					?	?	?	?	?	?																		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	T	S	K	A	L	V	I	D	T	S	P	I	E	K	E	I	S	N	I	I	S	H	N	G	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand