Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39410 Date Thu Jan 5 12:00:47 GMT 2012 Unique Job ID daa35e288fb3a8a2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	L	T	D	L	L	L	Q	G	P	R	S	A	P	E	L	R	Q	R	L	A	I	S	Q	A	T	F	S	R	L	V	A	R	E	D	R	V	I	R	F	G	K	A	R	A	T	R	Y	A	L	L	R	P	Y	R	G	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?								?	?	?	?									?	?	?	?	?	?			?		?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	I	P	V	W	R	V	D	D	T	G	K	A	H	K	F	A	D	I	R	L	C	W	P	Q	G	S	C	L	V	T	G	A	D	G	D	E	Q	W	F	D	G	L	P	W	Y	L	T	D	L	R	P	Q	G	F	L	G	R	A	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	R	K	L	A	A	Q	L	N	L	T	D	D	I	R	L	W	Q	E	E	D	V	L	Y	A	L	T	V	F	N	G	E	Y	T	G	G	W	L	V	G	E	G	N	Y	Q	R	W	I	T	A	Q	H	P	A	E	I	P	L	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	L	T	H	Y	E	Q	L	A	S	D	A	L	A	G	E	I	V	G	S	S	A	G	G	E	Q	P	K	F	T	Y	Y	A	Q	T	P	S	G	N	K	H	V	L	V	K	F	T	V	P	Q	Q	T	A	V	S	Q	R	W	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	L	I	A	E	S	I	A	A	Q	I	L	R	D	G	G	I	H	A	I	E	S	T	V	L	V	T	S	N	R	Q	V	F	L	E	A	E	R	F	D	C	K	G	N	D	G	R	L	P	I	V	S	L	E	A	V	Q	S	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	S	S	P	G	S	W	P	Q	A	M	R	R	L	C	E	Q	Q	L	V	T	H	Q	S	V	A	Q	T	E	V	I	W	A	F	G	R	L	I	A	N	S	D	M	H	A	G	N	L	S	F	Y	L	S	E	P	P	F	A	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	V	Y	D	M	L	P	M	V	Y	A	P	N	S	A	G	M	L	R	D	A	A	I	E	V	K	F	D	L	N	V	S	K	S	A	W	L	T	A	I	P	L	A	Q	Q	F	W	Q	T	V	A	R	D	P	R	I	S	E	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?	?					?		?		?	?	?	?		?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Sequence		R	H	I	A	Q	E	M	P	E	K	I	R	Q	I	E	E	K	V	A	R	M	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand