Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A6S3 Date Thu Jan 5 11:03:47 GMT 2012 Unique Job ID da7d69979570da22

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	K	F	L	S	A	L	I	L	L	L	V	T	T	A	A	Q	A	E	R	I	R	D	L	T	S	V	Q	G	V	R	Q	N	S	L	I	G	Y	G	L	V	V	G	L	D	G	T	G	D	Q	T	T	Q	T	P	F	T	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	L	N	N	M	L	S	Q	L	G	I	T	V	P	T	G	T	N	M	Q	L	K	N	V	A	A	V	M	V	T	A	S	L	P	P	F	G	R	Q	G	Q	T	I	D	V	V	V	S	S	M	G	N	A	K	S	L	R	G	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?			?			?	?	?	?	?	?	?	?												?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	M	T	P	L	K	G	V	D	S	Q	V	Y	A	L	A	Q	G	N	I	L	V	G	G	A	G	A	S	A	G	G	S	S	V	Q	V	N	Q	L	N	G	G	R	I	T	N	G	A	V	I	E	R	E	L	P	S	Q	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	G	N	T	L	N	L	Q	L	N	D	E	D	F	S	M	A	Q	Q	I	A	D	T	I	N	R	V	R	G	Y	G	S	A	T	A	L	D	A	R	T	I	Q	V	R	V	P	S	G	N	S	S	Q	V	R	F	L	A	D	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?										?	?																							?	?		?								?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	M	Q	V	N	V	T	P	Q	D	A	K	V	V	I	N	S	R	T	G	S	V	V	M	N	R	E	V	T	L	D	S	C	A	V	A	Q	G	N	L	S	V	T	V	N	R	Q	A	N	V	S	Q	P	D	T	P	F	G	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?															?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	T	V	V	T	P	Q	T	Q	I	D	L	R	Q	S	G	G	S	L	Q	S	V	R	S	S	A	S	L	N	N	V	V	R	A	L	N	A	L	G	A	T	P	M	D	L	M	S	I	L	Q	S	M	Q	S	A	G	C	L	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?											?																		?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		K	L	E	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand