Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77611 Date Thu Jan 5 12:31:03 GMT 2012 Unique Job ID d9feed05aca3bae3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	L	F	S	A	F	R	K	N	K	I	W	D	F	N	G	G	I	H	P	P	E	M	K	T	Q	S	N	G	T	P	L	R	Q	V	P	L	A	Q	R	F	V	I	P	L	K	Q	H	I	G	A	E	G	E	L	C	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?				?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	G	D	K	V	L	R	G	Q	P	L	T	R	G	R	G	K	M	L	P	V	H	A	P	T	S	G	T	V	T	A	I	A	P	H	S	T	A	H	P	S	A	L	A	E	L	S	V	I	I	D	A	D	G	E	D	C	W	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	D	G	W	A	D	Y	R	T	R	S	R	E	E	L	I	E	R	I	H	Q	F	G	V	A	G	L	G	G	A	G	F	P	T	G	V	K	L	Q	G	G	G	D	K	I	E	T	L	I	I	N	A	A	E	C	E	P	Y	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	D	D	R	L	M	Q	D	C	A	A	Q	V	V	E	G	I	R	I	L	A	H	I	L	Q	P	R	E	I	L	I	G	I	E	D	N	K	P	Q	A	I	S	M	L	R	A	V	L	A	D	S	N	D	I	S	L	R	V	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	K	Y	P	S	G	G	A	K	Q	L	T	Y	I	L	T	G	K	Q	V	P	H	G	G	R	S	S	D	I	G	V	L	M	Q	N	V	G	T	A	Y	A	V	K	R	A	V	I	D	G	E	P	I	T	E	R	V	V	T	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	E	A	I	A	R	P	G	N	V	W	A	R	L	G	T	P	V	R	H	L	L	N	D	A	G	F	C	P	S	A	D	Q	M	V	I	M	G	G	P	L	M	G	F	T	L	P	W	L	D	V	P	V	V	K	I	T	N	C	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	A	P	S	A	N	E	L	G	E	P	Q	E	E	Q	S	C	I	R	C	S	A	C	A	D	A	C	P	A	D	L	L	P	Q	Q	L	Y	W	F	S	K	G	Q	Q	H	D	K	A	T	T	H	N	I	A	D	C	I	E	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?		?		?		?																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	C	A	W	V	C	P	S	N	I	P	L	V	Q	Y	F	R	Q	E	K	A	E	I	A	A	I	R	Q	E	E	K	R	A	A	E	A	K	A	R	F	E	A	R	Q	A	R	L	E	R	E	K	A	A	R	L	E	R	H	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	A	V	Q	P	A	A	K	D	K	D	A	I	A	A	A	L	A	R	V	K	E	K	Q	A	Q	A	T	Q	P	I	V	I	K	A	G	E	R	P	D	N	S	A	I	I	A	A	R	E	A	R	K	A	Q	A	R	A	K	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	L	Q	Q	T	N	D	A	A	T	V	A	D	P	R	K	T	A	V	E	A	A	I	A	R	A	K	A	R	K	L	E	Q	Q	Q	A	N	A	E	P	E	Q	Q	V	D	P	R	K	A	A	V	E	A	A	I	A	R	A	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?								?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	K	L	E	Q	Q	Q	A	N	A	E	P	E	E	Q	V	D	P	R	K	A	A	V	E	A	A	I	A	R	A	K	A	R	K	L	E	Q	Q	Q	A	N	A	E	P	E	Q	Q	V	D	P	R	K	A	A	V	E	A	A	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?	?	?	?	?	?									?									?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		R	A	K	A	R	K	R	E	Q	Q	P	A	N	A	E	P	E	E	Q	V	D	P	R	K	A	A	V	E	A	A	I	A	R	A	K	A	R	K	L	E	Q	Q	Q	A	N	A	V	P	E	E	Q	V	D	P	R	K	A	A	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?								?	?				?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
Sequence		A	A	I	A	R	A	Q	A	K	K	A	A	Q	Q	K	V	V	N	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand