Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG20 Date Thu Jan 5 11:27:53 GMT 2012 Unique Job ID d7085604ab271c15

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	A	V	R	S	A	H	I	N	K	A	G	E	F	D	P	E	K	W	I	A	S	L	G	I	T	S	Q	K	S	C	E	C	L	A	E	T	W	A	Y	C	L	Q	Q	T	Q	G	H	P	D	A	S	L	L	L	W	R	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	M	V	E	I	L	S	T	L	S	M	D	I	D	T	L	R	A	A	L	L	F	P	L	A	D	A	N	V	V	S	E	D	V	L	R	E	S	V	G	K	S	V	V	N	L	I	H	G	V	R	D	M	A	A	I	R	Q	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	T	H	T	D	S	V	S	S	E	Q	V	D	N	V	R	R	M	L	L	A	M	V	D	D	F	R	C	V	V	I	K	L	A	E	R	I	A	H	L	R	E	V	K	D	A	P	E	D	E	R	V	L	A	A	K	E	C	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	Y	A	P	L	A	N	R	L	G	I	G	Q	L	K	W	E	L	E	D	Y	C	F	R	Y	L	H	P	T	E	Y	K	R	I	A	K	L	L	H	E	R	R	L	D	R	E	H	Y	I	E	E	F	V	G	H	L	R	A	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	A	E	G	V	K	A	E	V	Y	G	R	P	K	H	I	Y	S	I	W	R	K	M	Q	K	K	N	L	A	F	D	E	L	F	D	V	R	A	V	R	I	V	A	E	R	L	Q	D	C	Y	A	A	L	G	I	V	H	T	H	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	H	L	P	D	E	F	D	D	Y	V	A	N	P	K	P	N	G	Y	Q	S	I	H	T	V	V	L	G	P	G	G	K	T	V	E	I	Q	I	R	T	K	Q	M	H	E	D	A	E	L	G	V	A	A	H	W	K	Y	K	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?																																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	A	A	G	G	A	R	S	G	H	E	D	R	I	A	W	L	R	K	L	I	A	W	Q	E	E	M	A	D	S	G	E	M	L	D	E	V	R	S	Q	V	F	D	D	R	V	Y	V	F	T	P	K	G	D	V	V	D	L	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	S	T	P	L	D	F	A	Y	H	I	H	S	D	V	G	H	R	C	I	G	A	K	I	G	G	R	I	V	P	F	T	Y	Q	L	Q	M	G	D	Q	I	E	I	I	T	Q	K	Q	P	N	P	S	R	D	W	L	N	P	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		G	Y	V	T	T	S	R	G	R	S	K	I	H	A	W	F	R	K	Q	D	R	D	K	N	I	L	A	G	R	Q	I	L	D	D	E	L	E	H	L	G	I	S	L	K	E	A	E	K	H	L	L	P	R	Y	N	F	N	D	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	L	L	A	A	I	G	G	G	D	I	R	L	N	Q	M	V	N	F	L	Q	S	Q	F	N	K	P	S	A	E	E	Q	D	A	A	A	L	K	Q	L	Q	Q	K	S	Y	T	P	Q	N	R	S	K	D	N	G	R	V	V	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		G	V	G	N	L	M	H	H	I	A	R	C	C	Q	P	I	P	G	D	E	I	V	G	F	I	T	Q	G	R	G	I	S	V	H	R	A	D	C	E	Q	L	A	E	L	R	S	H	A	P	E	R	I	V	D	A	V	W	G	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?		?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		Y	S	A	G	Y	S	L	V	V	R	V	V	A	N	D	R	S	G	L	L	R	D	I	T	T	I	L	A	N	E	K	V	N	V	L	G	V	A	S	R	S	D	T	K	Q	Q	L	A	T	I	D	M	T	I	E	I	Y	N	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?																										?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
Sequence		V	L	G	R	V	L	G	K	L	N	Q	V	P	D	V	I	D	A	R	R	L	H	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?		?						?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand