Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75995 Date Wed Jan 25 15:21:04 GMT 2012 Unique Job ID d5f7e2f3a2abf142

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	N	T	L	I	P	I	L	V	A	I	C	L	F	I	T	G	V	A	I	L	N	I	Q	L	W	Y	S	A	K	A	E	Y	L	A	G	A	R	Y	A	A	N	N	I	N	H	I	L	E	E	A	S	Q	A	T	Q	T	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	I	A	G	K	E	C	N	L	E	E	Q	Y	Q	L	G	T	E	A	A	L	K	P	H	L	R	T	I	I	I	L	K	Q	G	I	V	W	C	T	S	L	P	G	N	R	V	L	L	S	R	I	P	V	F	P	D	S	N	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																	?		?	?	?																										?		?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	P	A	I	D	T	V	N	R	L	P	I	L	L	Y	Q	N	Q	F	A	D	T	R	I	L	V	T	I	S	D	Q	H	I	R	G	A	L	N	V	P	L	K	G	V	R	Y	V	L	R	V	A	D	D	I	I	G	P	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?	?			?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	V	M	T	L	N	G	H	Y	P	Y	T	E	K	V	H	S	T	K	Y	H	F	T	I	I	F	N	P	P	P	L	F	S	F	Y	R	L	I	D	K	G	F	G	I	L	I	F	I	L	L	I	A	C	A	A	A	F	L	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?			?								?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	Y	F	N	K	S	A	T	P	E	E	I	L	R	R	A	I	N	N	G	E	I	V	P	F	Y	Q	P	V	V	N	G	R	E	G	T	L	R	G	V	E	V	L	A	R	W	K	Q	P	H	G	G	Y	I	S	P	A	A	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	L	A	E	K	S	G	L	I	V	P	L	T	Q	S	L	M	N	Q	V	A	R	Q	M	N	A	I	A	S	K	L	P	E	G	F	H	I	G	I	N	F	S	A	S	H	I	I	S	P	T	F	V	D	E	C	L	N	F	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	F	T	R	R	D	L	N	L	V	L	E	V	T	E	R	E	P	L	N	V	D	E	S	L	V	Q	R	L	N	I	L	H	E	N	G	F	V	I	A	L	D	D	F	G	T	G	Y	S	G	L	S	Y	L	H	D	L	H	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	I	K	I	D	H	S	F	V	G	R	V	N	A	D	P	E	S	T	R	I	L	D	C	V	L	D	L	A	R	K	L	S	I	S	I	V	A	E	G	V	E	T	K	E	Q	L	D	Y	L	N	Q	N	Y	I	T	F	Q	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	Y	F	Y	K	P	V	T	Y	I	D	L	V	K	I	I	L	S	K	P	K	V	K	V	V	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand