Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG14 Date Thu Jan 5 11:27:48 GMT 2012 Unique Job ID d5d7544fe5e0cacd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	L	L	S	E	Y	G	L	F	L	A	K	I	V	T	V	V	L	A	I	A	A	I	A	A	I	I	V	N	V	A	Q	R	N	K	R	Q	R	G	E	L	R	V	N	N	L	S	E	Q	Y	K	E	M	K	E	E	L	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	M	D	S	H	Q	Q	K	Q	W	H	K	A	Q	K	K	K	H	K	Q	E	A	K	A	A	K	A	K	A	K	L	G	E	V	A	T	D	S	K	P	R	V	W	V	L	D	F	K	G	S	M	D	A	H	E	V	N	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	E	E	I	T	A	V	L	A	A	F	K	P	Q	D	Q	V	V	L	R	L	E	S	P	G	G	M	V	H	G	Y	G	L	A	A	S	Q	L	Q	R	L	R	D	K	N	I	P	L	T	V	T	V	D	K	V	A	A	S	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	M	M	A	C	V	A	D	K	I	V	S	A	P	F	A	I	V	G	S	I	G	V	V	A	Q	M	P	N	F	N	R	F	L	K	S	K	D	I	D	I	E	L	H	T	A	G	Q	Y	K	R	T	L	T	L	L	G	E	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	E	G	R	E	K	F	R	E	E	L	N	E	T	H	Q	L	F	K	D	F	V	K	R	M	R	P	S	L	D	I	E	Q	V	A	T	G	E	H	W	Y	G	Q	Q	A	V	E	K	G	L	V	D	E	I	N	T	S	D	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	L	S	L	M	E	G	R	E	V	V	N	V	R	Y	M	Q	R	K	R	L	I	D	R	F	T	G	S	A	A	E	S	A	D	R	L	L	L	R	W	W	Q	R	G	Q	K	P	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand