Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46899 Date Thu Jan 5 12:35:39 GMT 2012 Unique Job ID d5c3a8c701afa583

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	N	F	I	N	I	H	V	L	I	S	H	S	P	S	C	L	N	R	D	D	M	N	M	Q	K	D	A	I	F	G	G	K	R	R	V	R	I	S	S	Q	S	L	K	R	A	M	R	K	S	G	Y	Y	A	Q	N	I	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	S	L	R	T	I	H	L	A	Q	L	R	D	V	L	R	Q	K	L	G	E	R	F	D	Q	K	I	I	D	K	T	L	A	L	L	S	G	K	S	V	D	E	A	E	K	I	S	A	D	A	V	T	P	W	V	V	G	E	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																				?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	F	C	E	Q	V	A	K	A	E	A	D	N	L	D	D	K	K	L	L	K	V	L	K	E	D	I	A	A	I	R	V	N	L	Q	Q	G	V	D	I	A	L	S	G	R	M	A	T	S	G	M	M	T	E	L	G	K	V	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?	?	?	?	?	?	?			?	?	?						?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	M	S	I	A	H	A	I	T	T	H	Q	V	D	S	D	I	D	W	F	T	A	V	D	D	L	Q	E	Q	G	S	A	H	L	G	T	Q	E	F	S	S	G	V	F	Y	R	Y	A	N	I	N	L	A	Q	L	Q	E	N	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	A	S	R	E	Q	A	L	E	I	A	T	H	V	V	H	M	L	A	T	E	V	P	G	A	K	Q	R	T	Y	A	A	F	N	P	A	D	M	V	M	V	N	F	S	D	M	P	L	S	M	A	N	A	F	E	K	A	V	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?			?			?	?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	D	G	F	L	Q	P	S	I	Q	A	F	N	Q	Y	W	D	R	V	A	N	G	Y	G	L	N	G	A	A	A	Q	F	S	L	S	D	V	D	P	I	T	A	Q	V	K	Q	M	P	T	L	E	Q	L	K	S	W	V	R	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																				?	?	?	?	?	?			?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		G	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand