Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AEC5 Date Thu Jan 5 11:23:00 GMT 2012 Unique Job ID d424f9ddcc5b7e54

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	N	Y	S	L	R	A	R	M	M	I	L	I	L	A	P	T	V	L	I	G	L	L	L	S	I	F	F	V	V	H	R	Y	N	D	L	Q	R	Q	L	E	D	A	G	A	S	I	I	E	P	L	A	V	S	T	E	Y	G	M
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																																			?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	L	Q	N	R	E	S	I	G	Q	L	I	S	V	L	H	R	R	H	S	D	I	V	R	A	I	S	V	Y	D	E	N	N	R	L	F	V	T	S	N	F	H	L	D	P	S	S	M	Q	L	G	S	N	V	P	F	P	R	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?		?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	V	T	R	D	G	D	I	M	I	L	R	T	P	I	I	S	E	S	Y	S	P	D	E	S	P	S	S	D	A	K	N	S	Q	N	M	L	G	Y	I	A	L	E	L	D	L	K	S	V	R	L	Q	Q	Y	K	E	I	F	I	S
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Disorder		?	?	?	?	?			?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	V	M	M	L	F	C	I	G	I	A	L	I	F	G	W	R	L	M	R	D	V	T	G	P	I	R	N	M	V	N	T	V	D	R	I	R	R	G	Q	L	D	S	R	V	E	G	F	M	L	G	E	L	D	M	L	K	N	G	I
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Disorder																																							?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	S	M	A	M	S	L	A	A	Y	H	E	E	M	Q	H	N	I	D	Q	A	T	S	D	L	R	E	T	L	E	Q	M	E	I	Q	N	V	E	L	D	L	A	K	K	R	A	Q	E	A	A	R	I	K	S	E	F	L	A	N	M
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	H	E	L	R	T	P	L	N	G	V	I	G	F	T	R	L	T	L	K	T	E	L	T	P	T	Q	R	D	H	L	N	T	I	E	R	S	A	N	N	L	L	A	I	I	N	D	V	L	D	F	S	K	L	E	A	G	K	L	I
Secondary structure
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Disorder																					?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	E	S	I	P	F	P	L	R	S	T	L	D	E	V	V	T	L	L	A	H	S	S	H	D	K	G	L	E	L	T	L	N	I	K	S	D	V	P	D	N	V	I	G	D	P	L	R	L	Q	Q	I	I	T	N	L	V	G	N	A
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	K	F	T	E	N	G	N	I	D	I	L	V	E	K	R	A	L	S	N	T	K	V	Q	I	E	V	Q	I	R	D	T	G	I	G	I	P	E	R	D	Q	S	R	L	F	Q	A	F	R	Q	A	D	A	S	I	S	R	R	H	G
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Disorder																			?	?																							?	?	?		?				?		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	T	G	L	G	L	V	I	T	Q	K	L	V	N	E	M	G	G	D	I	S	F	H	S	Q	P	N	R	G	S	T	F	W	F	H	I	N	L	D	L	N	P	N	I	I	I	E	G	P	S	T	Q	C	L	A	G	K	R	L	A
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	V	E	P	N	S	A	A	A	Q	C	T	L	D	I	L	S	E	T	P	L	E	V	V	Y	S	P	T	F	S	A	L	P	P	A	H	Y	D	M	M	L	L	G	I	A	V	T	F	R	E	P	L	T	M	Q	H	E	R	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	A	V	S	M	T	D	F	L	M	L	A	L	P	C	H	A	Q	V	N	A	E	K	L	K	Q	D	G	I	G	A	C	L	L	K	P	L	T	P	T	R	L	L	P	A	L	T	E	F	C	H	H	K	Q	N	T	L	L	P	V
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	D	E	S	K	L	A	M	T	V	M	A	V	D	D	N	P	A	N	L	K	L	I	G	A	L	L	E	D	M	V	Q	H	V	E	L	C	D	S	G	H	Q	A	V	E	R	A	K	Q	M	P	F	D	L	I	L	M	D	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		M	P	D	M	D	G	I	R	A	C	E	L	I	H	Q	L	P	H	Q	Q	Q	T	P	V	I	A	V	T	A	H	A	M	A	G	Q	K	E	K	L	L	G	A	G	M	S	D	Y	L	A	K	P	I	E	E	E	R	L	H	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	L	R	Y	K	P	G	S	G	I	S	S	R	V	V	T	P	E	V	N	E	I	V	V	N	P	N	A	T	L	D	W	Q	L	A	L	R	Q	A	A	G	K	T	D	L	A	R	D	M	L	Q	M	L	L	D	F	L	P	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		R	N	K	V	E	E	Q	L	V	G	E	N	P	E	G	L	V	D	L	I	H	K	L	H	G	S	C	G	Y	S	G	V	P	R	M	K	N	L	C	Q	L	I	E	Q	Q	L	R	S	G	T	K	E	E	D	L	E	P	E	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																																						?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		E	L	L	D	E	M	D	N	V	A	R	E	A	S	K	I	L	G
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SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence