Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A8V2 Date Wed Jan 25 15:20:19 GMT 2012 Unique Job ID d381a67183fa0e58

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	Y	S	Y	T	E	K	K	R	I	R	K	D	F	G	K	R	P	Q	V	L	D	V	P	Y	L	L	S	I	Q	L	D	S	F	Q	K	F	I	E	Q	D	P	E	G	Q	Y	G	L	E	A	A	F	R	S	V	F	P	I	Q
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?										?																								?	?	?	?	?								?					?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	Y	S	G	N	S	E	L	Q	Y	V	S	Y	R	L	G	E	P	V	F	D	V	Q	E	C	Q	I	R	G	V	T	Y	S	A	P	L	R	V	K	L	R	L	V	I	Y	E	R	E	A	P	E	G	T	V	K	D	I	K	E	Q
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Disorder																																																?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	V	Y	M	G	E	I	P	L	M	T	D	N	G	T	F	V	I	N	G	T	E	R	V	I	V	S	Q	L	H	R	S	P	G	V	F	F	D	S	D	K	G	K	T	H	S	S	G	K	V	L	Y	N	A	R	I	I	P	Y	R
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Disorder																												?		?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	S	W	L	D	F	E	F	D	P	K	D	N	L	F	V	R	I	D	R	R	R	K	L	P	A	T	I	I	L	R	A	L	N	Y	T	T	E	Q	I	L	D	L	F	F	E	K	V	I	F	E	I	R	D	N	K	L	Q	M	E
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Sequence		L	V	P	E	R	L	R	G	E	T	A	S	F	D	I	E	A	N	G	K	V	Y	V	E	K	G	R	R	I	T	A	R	H	I	R	Q	L	E	K	D	D	V	K	L	I	E	V	P	V	E	Y	I	A	G	K	V	V	A	K	D
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Sequence		Y	I	D	E	S	T	G	E	L	I	C	A	A	N	M	E	L	S	L	D	L	L	A	K	L	S	Q	S	G	H	K	R	I	E	T	L	F	T	N	D	L	D	H	G	P	Y	I	S	E	T	L	R	V	D	P	T	N	D	R	L
Secondary structure
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Disorder																?	?	?											?															?												?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	A	L	V	E	I	Y	R	M	M	R	P	G	E	P	P	T	R	E	A	A	E	S	L	F	E	N	L	F	F	S	E	D	R	Y	D	L	S	A	V	G	R	M	K	F	N	R	S	L	L	R	E	E	I	E	G	S	G	I	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	K	D	D	I	I	D	V	M	K	K	L	I	D	I	R	N	G	K	G	E	V	D	D	I	D	H	L	G	N	R	R	I	R	S	V	G	E	M	A	E	N	Q	F	R	V	G	L	V	R	V	E	R	A	V	K	E	R	L	S
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Sequence		L	G	D	L	D	T	L	M	P	Q	D	M	I	N	A	K	P	I	S	A	A	V	K	E	F	F	G	S	S	Q	L	S	Q	F	M	D	Q	N	N	P	L	S	E	I	T	H	K	R	R	I	S	A	L	G	P	G	G	L	T	R
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Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?																										?		?								?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	R	A	G	F	E	V	R	D	V	H	P	T	H	Y	G	R	V	C	P	I	E	T	P	E	G	P	N	I	G	L	I	N	S	L	S	V	Y	A	Q	T	N	E	Y	G	F	L	E	T	P	Y	R	K	V	T	D	G	V	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																														?					?	?	?		?	?						?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		D	E	I	H	Y	L	S	A	I	E	E	G	N	Y	V	I	A	Q	A	N	S	N	L	D	E	E	G	H	F	V	E	D	L	V	T	C	R	S	K	G	E	S	S	L	F	S	R	D	Q	V	D	Y	M	D	V	S	T	Q	Q	V
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	S	V	G	A	S	L	I	P	F	L	E	H	D	D	A	N	R	A	L	M	G	A	N	M	Q	R	Q	A	V	P	T	L	R	A	D	K	P	L	V	G	T	G	M	E	R	A	V	A	V	D	S	G	V	T	A	V	A	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	G	V	V	Q	Y	V	D	A	S	R	I	V	I	K	V	N	E	D	E	M	Y	P	G	E	A	G	I	D	I	Y	N	L	T	K	Y	T	R	S	N	Q	N	T	C	I	N	Q	M	P	C	V	S	L	G	E	P	V	E	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?				?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		D	V	L	A	D	G	P	S	T	D	L	G	E	L	A	L	G	Q	N	M	R	V	A	F	M	P	W	N	G	Y	N	F	E	D	S	I	L	V	S	E	R	V	V	Q	E	D	R	F	T	T	I	H	I	Q	E	L	A	C	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		R	D	T	K	L	G	P	E	E	I	T	A	D	I	P	N	V	G	E	A	A	L	S	K	L	D	E	S	G	I	V	Y	I	G	A	E	V	T	G	G	D	I	L	V	G	K	V	T	P	K	G	E	T	Q	L	T	P	E	E	K
Secondary structure
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Disorder			?	?	?	?	?	?	?			?	?	?				?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		L	L	R	A	I	F	G	E	K	A	S	D	V	K	D	S	S	L	R	V	P	N	G	V	S	G	T	V	I	D	V	Q	V	F	T	R	D	G	V	E	K	D	K	R	A	L	E	I	E	E	M	Q	L	K	Q	A	K	K	D	L
Secondary structure
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Disorder																																								?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		S	E	E	L	Q	I	L	E	A	G	L	F	S	R	I	R	A	V	L	V	A	G	G	V	E	A	E	K	L	D	K	L	P	R	D	R	W	L	E	L	G	L	T	D	E	E	K	Q	N	Q	L	E	Q	L	A	E	Q	Y	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?			?																									?				?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		L	K	H	E	F	E	K	K	L	E	A	K	R	R	K	I	T	Q	G	D	D	L	A	P	G	V	L	K	I	V	K	V	Y	L	A	V	K	R	R	I	Q	P	G	D	K	M	A	G	R	H	G	N	K	G	V	I	S	K	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?		?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		P	I	E	D	M	P	Y	D	E	N	G	T	P	V	D	I	V	L	N	P	L	G	V	P	S	R	M	N	I	G	Q	I	L	E	T	H	L	G	M	A	A	K	G	I	G	D	K	I	N	A	M	L	K	Q	Q	Q	E	V	A	K
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SS confidence
Disorder																																																							?	?	?	?	?	?	?
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Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?		?			?		?	?		?	?	?	?							?			?		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		L	G	D	L	P	T	S	G	Q	I	R	L	Y	D	G	R	T	G	E	Q	F	E	R	P	V	T	V	G	Y	M	Y	M	L	K	L	N	H	L	V	D	D	K	M	H	A	R	S	T	G	S	Y	S	L	V	T	Q	Q	P	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?					?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		G	K	A	Q	F	G	G	Q	R	F	G	E	M	E	V	W	A	L	E	A	Y	G	A	A	Y	T	L	Q	E	M	L	T	V	K	S	D	D	V	N	G	R	T	K	M	Y	K	N	I	V	D	G	N	H	Q	M	E	P	G	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.
Sequence		E	S	F	N	V	L	L	K	E	I	R	S	L	G	I	N	I	E	L	E	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?			?	?	?
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