Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P03024 Date Thu Jan 5 10:57:56 GMT 2012 Unique Job ID d37e38f55f7097f9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	I	K	D	V	A	R	L	A	G	V	S	V	A	T	V	S	R	V	I	N	N	S	P	K	A	S	E	A	S	R	L	A	V	H	S	A	M	E	S	L	S	Y	H	P	N	A	N	A	R	A	L	A	Q	Q	T	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																					?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	V	G	L	V	V	G	D	V	S	D	P	F	F	G	A	M	V	K	A	V	E	Q	V	A	Y	H	T	G	N	F	L	L	I	G	N	G	Y	H	N	E	Q	K	E	R	Q	A	I	E	Q	L	I	R	H	R	C	A	A	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	H	A	K	M	I	P	D	A	D	L	A	S	L	M	K	Q	M	P	G	M	V	L	I	N	R	I	L	P	G	F	E	N	R	C	I	A	L	D	D	R	Y	G	A	W	L	A	T	R	H	L	I	Q	Q	G	H	T	R	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	L	C	S	N	H	S	I	S	D	A	E	D	R	L	Q	G	Y	Y	D	A	L	A	E	S	G	I	A	A	N	D	R	L	V	T	F	G	E	P	D	E	S	G	G	E	Q	A	M	T	E	L	L	G	R	G	R	N	F	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	A	C	Y	N	D	S	M	A	A	G	A	M	G	V	L	N	D	N	G	I	D	V	P	G	E	I	S	L	I	G	F	D	D	V	L	V	S	R	Y	V	R	P	R	L	T	T	V	R	Y	P	I	V	T	M	A	T	Q	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Sequence		E	L	A	L	A	L	A	D	N	R	P	L	P	E	I	T	N	V	F	S	P	T	L	V	R	R	H	S	V	S	T	P	S	L	E	A	S	H	H	A	T	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?		?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand