Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16926 Date Thu Jan 5 11:35:56 GMT 2012 Unique Job ID d33cdbbe8354893e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	P	I	F	S	R	G	P	S	L	Q	I	R	L	I	L	A	V	L	V	A	L	G	I	I	I	A	D	S	R	L	G	T	F	S	Q	I	R	T	Y	M	D	T	A	V	S	P	F	Y	F	V	S	N	A	P	R	E	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	G	V	S	Q	T	L	A	S	R	D	Q	L	E	L	E	N	R	A	L	R	Q	E	L	L	L	K	N	S	E	L	L	M	L	G	Q	Y	K	Q	E	N	A	R	L	R	E	L	L	G	S	P	L	R	Q	D	E	Q	K	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	Q	V	I	S	T	V	N	D	P	Y	S	D	Q	V	V	I	D	K	G	S	V	N	G	V	Y	E	G	Q	P	V	I	S	D	K	G	V	V	G	Q	V	V	A	V	A	K	L	T	S	R	V	L	L	I	C	D	A	T	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?																																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	I	Q	V	L	R	N	D	I	R	V	I	A	A	G	N	G	C	T	D	D	L	Q	L	E	H	L	P	A	N	T	D	I	R	V	G	D	V	L	V	T	S	G	L	G	G	R	F	P	E	G	Y	P	V	A	V	V	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?						?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	K	L	D	T	Q	R	A	Y	T	V	I	Q	A	R	P	T	A	G	L	Q	R	L	R	Y	L	L	L	L	W	G	A	D	R	N	G	A	N	P	M	T	P	E	E	V	H	R	V	A	N	E	R	L	M	Q	M	M	P	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		L	P	S	P	D	A	M	G	P	K	L	P	E	P	A	T	G	I	A	Q	P	T	P	Q	Q	P	A	T	G	N	A	A	T	A	P	A	A	P	T	Q	P	A	A	N	R	S	P	Q	R	A	T	P	P	Q	S	G	A	Q	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	R	A	P	G	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand