Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AEJ4 Date Thu Jan 5 11:23:28 GMT 2012 Unique Job ID d178836c122bdf28

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	R	L	R	F	S	P	R	S	S	F	A	R	T	L	L	L	I	V	T	L	L	F	A	S	L	V	T	T	Y	L	V	V	L	N	F	A	I	L	P	S	L	Q	Q	F	N	K	V	L	A	Y	E	V	R	M	L	M	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	L	Q	L	E	D	G	T	Q	L	V	V	P	P	A	F	R	R	E	I	Y	R	E	L	G	I	S	L	Y	S	N	E	A	A	E	E	A	G	L	R	W	A	Q	H	Y	E	F	L	S	H	Q	M	A	Q	Q	L	G	G	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?			?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	V	R	V	E	V	N	K	S	S	P	V	V	W	L	K	T	W	L	S	P	N	I	W	V	R	V	P	L	T	E	I	H	Q	G	D	F	S	P	L	F	R	Y	T	L	A	I	M	L	L	A	I	G	G	A	W	L	F	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	Q	N	R	P	L	V	D	L	E	H	A	A	L	Q	V	G	K	G	I	I	P	P	P	L	R	E	Y	G	A	S	E	V	R	S	V	T	R	A	F	N	H	M	A	A	G	V	K	Q	L	A	D	D	R	T	L	L	M	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?		?	?						?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	S	H	D	L	R	T	P	L	T	R	I	R	L	A	T	E	M	M	S	E	Q	D	G	Y	L	A	E	S	I	N	K	D	I	E	E	C	N	A	I	I	E	Q	F	I	D	Y	L	R	T	G	Q	E	M	P	M	E	M	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?																												?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	N	A	V	L	G	E	V	I	A	A	E	S	G	Y	E	R	E	I	E	T	A	L	Y	P	G	S	I	E	V	K	M	H	P	L	S	I	K	R	A	V	A	N	M	V	V	N	A	A	R	Y	G	N	G	W	I	K	V	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	T	E	P	N	R	A	W	F	Q	V	E	D	D	G	P	G	I	A	P	E	Q	R	K	H	L	F	Q	P	F	V	R	G	D	S	A	R	T	I	S	G	T	G	L	G	L	A	I	V	Q	R	I	V	D	N	H	N	G	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Sequence		E	L	G	T	S	E	R	G	G	L	S	I	R	A	W	L	P	V	P	V	T	R	A	Q	G	T	T	K	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand