Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75742 Date Thu Jan 5 12:13:40 GMT 2012 Unique Job ID d03c15ef5bfa440f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	H	A	S	Q	P	R	A	I	Y	Y	V	V	A	L	Q	I	W	E	Y	F	S	F	Y	G	M	R	A	L	L	I	L	Y	L	T	N	Q	L	K	Y	N	D	T	H	A	Y	E	L	F	S	A	Y	C	S	L	V	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	P	I	L	G	G	F	L	A	D	K	V	L	G	N	R	M	A	V	M	L	G	A	L	L	M	A	I	G	H	V	V	L	G	A	S	E	I	H	P	S	F	L	Y	L	S	L	A	I	I	V	C	G	Y	G	L	F	K	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	S	C	L	L	G	E	L	Y	E	P	T	D	P	R	R	D	G	G	F	S	L	M	Y	A	A	G	N	V	G	S	I	I	A	P	I	A	C	G	Y	A	Q	E	E	Y	S	W	A	M	G	F	G	L	A	A	V	G	M	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	L	V	I	F	L	C	G	N	R	H	F	T	H	T	R	G	V	N	K	K	V	L	R	A	T	N	F	L	L	P	N	W	G	W	L	L	V	L	L	V	A	T	P	A	L	I	T	I	L	F	W	K	E	W	S	V	Y	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?	?		?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	A	T	I	I	G	L	G	V	L	A	K	I	Y	R	K	A	E	N	Q	K	Q	R	K	E	L	G	L	I	V	T	L	T	F	F	S	M	L	F	W	A	F	A	Q	Q	G	G	S	S	I	S	L	Y	I	D	R	F	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	D	M	F	G	Y	T	V	P	T	A	M	F	Q	S	I	N	A	F	A	V	M	L	C	G	V	F	L	A	W	V	V	K	E	S	V	A	G	N	R	T	V	R	I	W	G	K	F	A	L	G	L	G	L	M	S	A	G	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	L	T	L	S	A	R	W	S	A	M	Y	G	H	S	S	L	P	L	M	V	L	G	L	A	V	M	G	F	A	E	L	F	I	D	P	V	A	M	S	Q	I	T	R	I	E	I	P	G	V	T	G	V	L	T	G	I	Y	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	G	A	I	A	N	Y	L	A	G	V	I	A	D	Q	T	S	Q	A	S	F	D	A	S	G	A	I	N	Y	S	I	N	A	Y	I	E	V	F	D	Q	I	T	W	G	A	L	A	C	V	G	L	V	L	M	I	W	L	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Sequence		A	L	K	F	R	N	R	A	L	A	L	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand