Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P69811 Date Thu Jan 5 12:12:04 GMT 2012 Unique Job ID cf69585b14c53b77

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	Q	L	S	V	Q	D	I	H	P	G	E	K	A	G	D	K	E	E	A	I	R	Q	V	A	A	A	L	V	Q	A	G	N	V	A	E	G	Y	V	N	G	M	L	A	R	E	Q	Q	T	S	T	F	L	G	N	G	I	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	H	G	T	T	D	T	R	D	Q	V	L	K	T	G	V	Q	V	F	Q	F	P	E	G	V	T	W	G	D	G	Q	V	A	Y	V	A	I	G	I	A	A	S	S	D	E	H	L	G	L	L	R	Q	L	T	H	V	L	S	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	V	A	E	Q	L	K	S	A	T	T	A	E	E	L	R	A	L	L	M	G	E	K	Q	S	E	Q	L	K	L	D	N	E	M	L	T	L	D	I	V	A	S	D	L	L	T	L	Q	A	L	N	A	A	R	L	K	E	A	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	D	A	T	F	V	T	K	A	I	N	E	Q	P	L	N	L	G	Q	G	I	W	L	S	D	S	A	E	G	N	L	R	S	A	I	A	V	S	R	A	A	N	A	F	D	V	D	G	E	T	A	A	M	L	V	S	V	A	M	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	D	Q	P	I	A	V	L	K	R	L	A	D	L	L	L	D	N	K	A	D	R	L	L	K	A	D	A	A	T	L	L	A	L	L	T	S	D	D	A	P	T	D	D	V	L	S	A	E	F	V	V	R	N	E	H	G	L	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?					?		?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	P	G	T	M	L	V	N	T	I	K	Q	F	N	S	D	I	T	V	T	N	L	D	G	T	G	K	P	A	N	G	R	S	L	M	K	V	V	A	L	G	V	K	K	G	H	R	L	R	F	T	A	Q	G	A	D	A	E	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	K	A	I	G	D	A	I	A	A	G	L	G	E	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand