Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39391 Date Thu Jan 5 12:00:24 GMT 2012 Unique Job ID ce4165e42eff0a1f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	W	G	F	V	F	V	S	F	I	S	K	E	L	A	L	G	Q	S	E	Y	I	S	W	V	K	C	T	S	W	L	S	N	F	V	N	L	R	G	L	R	Q	P	D	G	R	P	L	Y	E	Y	H	A	T	N	D	E	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	L	T	Q	L	L	R	A	V	G	Q	S	Q	S	N	I	C	N	R	D	F	A	A	C	F	V	L	F	C	S	E	W	Y	R	R	D	Y	E	R	Q	C	G	W	T	W	D	P	I	Y	K	K	I	G	I	S	F	T	A	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	G	T	I	V	P	K	G	M	E	D	Y	W	L	R	P	I	R	F	Y	E	S	E	R	R	N	F	L	G	T	L	F	S	E	G	G	L	P	F	R	L	L	K	E	S	D	S	R	F	L	A	V	F	S	R	I	L	G	Q	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?																			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	Q	A	K	Q	S	G	F	S	A	L	S	L	A	R	A	V	I	E	K	S	A	L	P	T	V	F	S	E	D	T	S	V	E	L	I	S	H	M	A	D	N	L	N	S	L	V	L	T	H	N	L	I	N	H	K	E	P	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?																																													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	E	K	V	H	P	T	W	R	S	E	F	P	I	P	L	D	D	E	T	G	T	H	F	L	N	G	L	L	C	A	A	S	V	E	A	K	P	R	L	Q	K	N	K	S	T	R	C	Q	F	Y	W	S	E	K	H	P	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	R	V	I	V	S	L	P	D	E	V	S	F	P	V	T	S	E	P	S	T	T	R	F	E	L	A	I	C	E	D	G	E	E	V	S	G	L	G	P	A	Y	A	S	L	E	N	R	Q	A	T	V	R	L	R	K	S	E	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	G	R	Q	N	P	S	A	G	L	S	L	V	A	R	A	G	G	M	I	V	G	S	I	K	L	D	D	S	E	I	A	I	G	E	V	P	L	T	F	I	V	D	A	D	Q	W	L	L	Q	G	Q	A	S	C	S	V	R	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?																							?	?	?	?																			?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	V	L	I	V	L	P	R	D	N	S	N	V	A	G	F	D	G	Q	S	R	A	V	N	V	L	G	L	K	A	L	P	V	K	G	C	Q	D	V	T	V	T	A	N	E	T	Y	R	I	R	T	G	R	E	Q	I	S	I	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Sequence		F	A	L	N	G	K	R	A	S	W	V	C	H	P	D	E	T	F	I	G	V	P	K	V	I	S	T	L	P	D	I	Q	S	I	D	V	T	R	Y	T	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?															?				?				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand