Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31545 Date Thu Jan 5 11:48:05 GMT 2012 Unique Job ID ce39836f0622b3bc

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	Y	K	D	E	N	G	V	N	E	P	S	R	R	R	L	L	K	V	I	G	A	L	A	L	A	G	S	C	P	V	A	H	A	Q	K	T	Q	S	A	P	G	T	L	S	P	D	A	R	N	E	K	Q	P	F	Y	G	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	A	G	I	L	T	P	Q	Q	A	A	M	M	L	V	A	F	D	V	L	A	S	D	K	A	D	L	E	R	L	F	R	L	L	T	Q	R	F	A	F	L	T	Q	G	G	A	A	P	E	T	P	N	P	R	L	P	P	L	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	I	L	G	G	Y	I	A	P	D	N	L	T	I	T	L	S	V	G	H	S	L	F	D	E	R	F	G	L	A	P	Q	M	P	K	K	L	Q	K	M	T	R	F	P	N	D	S	L	D	A	A	L	C	H	G	D	V	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?																						?					?					?			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	C	A	N	T	Q	D	T	V	I	H	A	L	R	D	I	I	K	H	T	P	D	L	L	S	V	R	W	K	R	E	G	F	I	S	D	H	A	A	R	S	K	G	K	E	T	P	I	N	L	L	G	F	K	D	G	T	A	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	S	Q	N	D	K	L	M	Q	K	V	V	W	V	T	A	D	Q	Q	E	P	A	W	T	I	G	G	S	Y	Q	A	V	R	L	I	Q	F	R	V	E	F	W	D	R	T	P	L	K	E	Q	Q	T	I	F	G	R	D	K	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	P	L	G	M	Q	H	E	H	D	V	P	D	Y	A	S	D	P	E	G	K	V	I	A	L	D	S	H	I	R	L	A	N	P	R	T	A	E	S	E	S	S	L	M	L	R	R	G	Y	S	Y	S	L	G	V	T	N	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?	?	?	?											?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	L	D	M	G	L	L	F	V	C	Y	Q	H	D	L	E	K	G	F	L	T	V	Q	K	R	L	N	G	E	A	L	E	E	Y	V	K	P	I	G	G	G	Y	F	F	A	L	P	G	V	K	D	A	N	D	Y	F	G	S	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		L	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand